Protein–RNA interactions for Protein: Q86V40

TRABD2A, Metalloprotease TIKI1, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRABD2AQ86V40 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRABD2AQ86V40 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRABD2AQ86V40 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRABD2AQ86V40 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRABD2AQ86V40 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRABD2AQ86V40 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRABD2AQ86V40 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRABD2AQ86V40 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRABD2AQ86V40 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRABD2AQ86V40 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRABD2AQ86V40 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRABD2AQ86V40 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRABD2AQ86V40 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRABD2AQ86V40 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRABD2AQ86V40 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRABD2AQ86V40 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TRABD2AQ86V40 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRABD2AQ86V40 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRABD2AQ86V40 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TRABD2AQ86V40 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRABD2AQ86V40 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRABD2AQ86V40 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRABD2AQ86V40 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRABD2AQ86V40 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRABD2AQ86V40 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRABD2AQ86V40 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRABD2AQ86V40 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRABD2AQ86V40 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRABD2AQ86V40 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRABD2AQ86V40 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRABD2AQ86V40 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRABD2AQ86V40 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRABD2AQ86V40 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRABD2AQ86V40 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRABD2AQ86V40 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRABD2AQ86V40 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRABD2AQ86V40 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRABD2AQ86V40 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRABD2AQ86V40 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRABD2AQ86V40 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRABD2AQ86V40 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TRABD2AQ86V40 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRABD2AQ86V40 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRABD2AQ86V40 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRABD2AQ86V40 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRABD2AQ86V40 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRABD2AQ86V40 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRABD2AQ86V40 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRABD2AQ86V40 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRABD2AQ86V40 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRABD2AQ86V40 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRABD2AQ86V40 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRABD2AQ86V40 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRABD2AQ86V40 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRABD2AQ86V40 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRABD2AQ86V40 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRABD2AQ86V40 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRABD2AQ86V40 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRABD2AQ86V40 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRABD2AQ86V40 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRABD2AQ86V40 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRABD2AQ86V40 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRABD2AQ86V40 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRABD2AQ86V40 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRABD2AQ86V40 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRABD2AQ86V40 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRABD2AQ86V40 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRABD2AQ86V40 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRABD2AQ86V40 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRABD2AQ86V40 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRABD2AQ86V40 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRABD2AQ86V40 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRABD2AQ86V40 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRABD2AQ86V40 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRABD2AQ86V40 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRABD2AQ86V40 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TRABD2AQ86V40 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRABD2AQ86V40 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRABD2AQ86V40 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRABD2AQ86V40 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRABD2AQ86V40 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRABD2AQ86V40 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRABD2AQ86V40 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRABD2AQ86V40 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRABD2AQ86V40 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRABD2AQ86V40 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRABD2AQ86V40 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TRABD2AQ86V40 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRABD2AQ86V40 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRABD2AQ86V40 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRABD2AQ86V40 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRABD2AQ86V40 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRABD2AQ86V40 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRABD2AQ86V40 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRABD2AQ86V40 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRABD2AQ86V40 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRABD2AQ86V40 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TRABD2AQ86V40 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRABD2AQ86V40 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRABD2AQ86V40 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms