Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NUP54Q7Z3B4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUP54Q7Z3B4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUP54Q7Z3B4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUP54Q7Z3B4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUP54Q7Z3B4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUP54Q7Z3B4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUP54Q7Z3B4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUP54Q7Z3B4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUP54Q7Z3B4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUP54Q7Z3B4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUP54Q7Z3B4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUP54Q7Z3B4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUP54Q7Z3B4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUP54Q7Z3B4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUP54Q7Z3B4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUP54Q7Z3B4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUP54Q7Z3B4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUP54Q7Z3B4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NUP54Q7Z3B4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUP54Q7Z3B4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUP54Q7Z3B4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUP54Q7Z3B4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUP54Q7Z3B4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUP54Q7Z3B4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUP54Q7Z3B4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUP54Q7Z3B4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUP54Q7Z3B4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUP54Q7Z3B4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUP54Q7Z3B4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUP54Q7Z3B4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUP54Q7Z3B4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUP54Q7Z3B4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NUP54Q7Z3B4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NUP54Q7Z3B4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
NUP54Q7Z3B4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUP54Q7Z3B4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUP54Q7Z3B4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUP54Q7Z3B4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUP54Q7Z3B4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUP54Q7Z3B4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUP54Q7Z3B4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NUP54Q7Z3B4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUP54Q7Z3B4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NUP54Q7Z3B4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUP54Q7Z3B4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUP54Q7Z3B4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUP54Q7Z3B4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUP54Q7Z3B4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP54Q7Z3B4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP54Q7Z3B4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP54Q7Z3B4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP54Q7Z3B4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP54Q7Z3B4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP54Q7Z3B4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUP54Q7Z3B4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUP54Q7Z3B4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUP54Q7Z3B4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUP54Q7Z3B4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUP54Q7Z3B4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUP54Q7Z3B4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP54Q7Z3B4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP54Q7Z3B4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP54Q7Z3B4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP54Q7Z3B4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP54Q7Z3B4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP54Q7Z3B4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP54Q7Z3B4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP54Q7Z3B4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP54Q7Z3B4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP54Q7Z3B4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP54Q7Z3B4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP54Q7Z3B4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP54Q7Z3B4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP54Q7Z3B4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP54Q7Z3B4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP54Q7Z3B4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP54Q7Z3B4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP54Q7Z3B4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUP54Q7Z3B4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUP54Q7Z3B4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUP54Q7Z3B4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUP54Q7Z3B4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NUP54Q7Z3B4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NUP54Q7Z3B4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUP54Q7Z3B4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NUP54Q7Z3B4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NUP54Q7Z3B4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP54Q7Z3B4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP54Q7Z3B4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP54Q7Z3B4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP54Q7Z3B4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP54Q7Z3B4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP54Q7Z3B4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP54Q7Z3B4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP54Q7Z3B4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP54Q7Z3B4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP54Q7Z3B4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP54Q7Z3B4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP54Q7Z3B4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms