Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUT9

DENND5B, DENN domain-containing protein 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND5BQ6ZUT9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DENND5BQ6ZUT9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DENND5BQ6ZUT9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DENND5BQ6ZUT9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DENND5BQ6ZUT9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DENND5BQ6ZUT9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DENND5BQ6ZUT9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DENND5BQ6ZUT9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DENND5BQ6ZUT9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DENND5BQ6ZUT9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DENND5BQ6ZUT9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DENND5BQ6ZUT9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DENND5BQ6ZUT9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DENND5BQ6ZUT9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DENND5BQ6ZUT9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
DENND5BQ6ZUT9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DENND5BQ6ZUT9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
DENND5BQ6ZUT9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DENND5BQ6ZUT9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DENND5BQ6ZUT9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DENND5BQ6ZUT9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DENND5BQ6ZUT9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
DENND5BQ6ZUT9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
DENND5BQ6ZUT9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
DENND5BQ6ZUT9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DENND5BQ6ZUT9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DENND5BQ6ZUT9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DENND5BQ6ZUT9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DENND5BQ6ZUT9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
DENND5BQ6ZUT9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
DENND5BQ6ZUT9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DENND5BQ6ZUT9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DENND5BQ6ZUT9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DENND5BQ6ZUT9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DENND5BQ6ZUT9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DENND5BQ6ZUT9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DENND5BQ6ZUT9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DENND5BQ6ZUT9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
DENND5BQ6ZUT9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DENND5BQ6ZUT9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DENND5BQ6ZUT9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DENND5BQ6ZUT9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DENND5BQ6ZUT9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DENND5BQ6ZUT9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
DENND5BQ6ZUT9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DENND5BQ6ZUT9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DENND5BQ6ZUT9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DENND5BQ6ZUT9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DENND5BQ6ZUT9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DENND5BQ6ZUT9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DENND5BQ6ZUT9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DENND5BQ6ZUT9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DENND5BQ6ZUT9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
DENND5BQ6ZUT9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DENND5BQ6ZUT9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DENND5BQ6ZUT9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DENND5BQ6ZUT9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DENND5BQ6ZUT9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DENND5BQ6ZUT9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DENND5BQ6ZUT9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DENND5BQ6ZUT9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DENND5BQ6ZUT9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DENND5BQ6ZUT9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DENND5BQ6ZUT9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DENND5BQ6ZUT9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DENND5BQ6ZUT9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DENND5BQ6ZUT9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DENND5BQ6ZUT9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DENND5BQ6ZUT9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DENND5BQ6ZUT9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
DENND5BQ6ZUT9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DENND5BQ6ZUT9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DENND5BQ6ZUT9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DENND5BQ6ZUT9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DENND5BQ6ZUT9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DENND5BQ6ZUT9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DENND5BQ6ZUT9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DENND5BQ6ZUT9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DENND5BQ6ZUT9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DENND5BQ6ZUT9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DENND5BQ6ZUT9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DENND5BQ6ZUT9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DENND5BQ6ZUT9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DENND5BQ6ZUT9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DENND5BQ6ZUT9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DENND5BQ6ZUT9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DENND5BQ6ZUT9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DENND5BQ6ZUT9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DENND5BQ6ZUT9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DENND5BQ6ZUT9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
DENND5BQ6ZUT9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DENND5BQ6ZUT9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DENND5BQ6ZUT9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DENND5BQ6ZUT9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DENND5BQ6ZUT9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DENND5BQ6ZUT9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DENND5BQ6ZUT9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DENND5BQ6ZUT9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DENND5BQ6ZUT9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DENND5BQ6ZUT9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms