Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWY9

PRPF40B, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40BQ6NWY9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PRPF40BQ6NWY9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PRPF40BQ6NWY9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PRPF40BQ6NWY9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PRPF40BQ6NWY9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PRPF40BQ6NWY9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PRPF40BQ6NWY9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PRPF40BQ6NWY9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
PRPF40BQ6NWY9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PRPF40BQ6NWY9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PRPF40BQ6NWY9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PRPF40BQ6NWY9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PRPF40BQ6NWY9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PRPF40BQ6NWY9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
PRPF40BQ6NWY9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
PRPF40BQ6NWY9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PRPF40BQ6NWY9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PRPF40BQ6NWY9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PRPF40BQ6NWY9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PRPF40BQ6NWY9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PRPF40BQ6NWY9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PRPF40BQ6NWY9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PRPF40BQ6NWY9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PRPF40BQ6NWY9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PRPF40BQ6NWY9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PRPF40BQ6NWY9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PRPF40BQ6NWY9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PRPF40BQ6NWY9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
PRPF40BQ6NWY9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PRPF40BQ6NWY9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PRPF40BQ6NWY9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PRPF40BQ6NWY9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PRPF40BQ6NWY9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PRPF40BQ6NWY9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PRPF40BQ6NWY9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PRPF40BQ6NWY9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PRPF40BQ6NWY9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PRPF40BQ6NWY9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PRPF40BQ6NWY9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PRPF40BQ6NWY9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PRPF40BQ6NWY9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PRPF40BQ6NWY9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
PRPF40BQ6NWY9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PRPF40BQ6NWY9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PRPF40BQ6NWY9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PRPF40BQ6NWY9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PRPF40BQ6NWY9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
PRPF40BQ6NWY9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PRPF40BQ6NWY9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PRPF40BQ6NWY9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
PRPF40BQ6NWY9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PRPF40BQ6NWY9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PRPF40BQ6NWY9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PRPF40BQ6NWY9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PRPF40BQ6NWY9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PRPF40BQ6NWY9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PRPF40BQ6NWY9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PRPF40BQ6NWY9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PRPF40BQ6NWY9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PRPF40BQ6NWY9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PRPF40BQ6NWY9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PRPF40BQ6NWY9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PRPF40BQ6NWY9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PRPF40BQ6NWY9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PRPF40BQ6NWY9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PRPF40BQ6NWY9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PRPF40BQ6NWY9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PRPF40BQ6NWY9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PRPF40BQ6NWY9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PRPF40BQ6NWY9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PRPF40BQ6NWY9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PRPF40BQ6NWY9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PRPF40BQ6NWY9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PRPF40BQ6NWY9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PRPF40BQ6NWY9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
PRPF40BQ6NWY9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PRPF40BQ6NWY9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PRPF40BQ6NWY9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PRPF40BQ6NWY9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PRPF40BQ6NWY9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PRPF40BQ6NWY9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
PRPF40BQ6NWY9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PRPF40BQ6NWY9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PRPF40BQ6NWY9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PRPF40BQ6NWY9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PRPF40BQ6NWY9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PRPF40BQ6NWY9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PRPF40BQ6NWY9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PRPF40BQ6NWY9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PRPF40BQ6NWY9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PRPF40BQ6NWY9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PRPF40BQ6NWY9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PRPF40BQ6NWY9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PRPF40BQ6NWY9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PRPF40BQ6NWY9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PRPF40BQ6NWY9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PRPF40BQ6NWY9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PRPF40BQ6NWY9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
PRPF40BQ6NWY9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PRPF40BQ6NWY9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms