Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU3

CHIC1, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC1Q5VXU3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
CHIC1Q5VXU3 AC005786.4-201ENST00000623369 682 ntBASIC40.1■■■■■ 4.01
CHIC1Q5VXU3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
CHIC1Q5VXU3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
CHIC1Q5VXU3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC40.1■■■■■ 4.01
CHIC1Q5VXU3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
CHIC1Q5VXU3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
CHIC1Q5VXU3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
CHIC1Q5VXU3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
CHIC1Q5VXU3 AC013391.2-201ENST00000559041 501 ntTSL 5 BASIC40.09■■■■■ 4.01
CHIC1Q5VXU3 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC40.09■■■■■ 4.01
CHIC1Q5VXU3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
CHIC1Q5VXU3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
CHIC1Q5VXU3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC40.08■■■■■ 4.01
CHIC1Q5VXU3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
CHIC1Q5VXU3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
CHIC1Q5VXU3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
CHIC1Q5VXU3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.08■■■■■ 4.01
CHIC1Q5VXU3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
CHIC1Q5VXU3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC40.07■■■■■ 4.01
CHIC1Q5VXU3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC40.07■■■■■ 4.01
CHIC1Q5VXU3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
CHIC1Q5VXU3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.07■■■■■ 4
CHIC1Q5VXU3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4
CHIC1Q5VXU3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
CHIC1Q5VXU3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC40.05■■■■■ 4
CHIC1Q5VXU3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.05■■■■■ 4
CHIC1Q5VXU3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
CHIC1Q5VXU3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
CHIC1Q5VXU3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
CHIC1Q5VXU3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
CHIC1Q5VXU3 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC40.04■■■■■ 4
CHIC1Q5VXU3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
CHIC1Q5VXU3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC40.04■■■■■ 4
CHIC1Q5VXU3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.03■■■■■ 4
CHIC1Q5VXU3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC40.03■■■■■ 4
CHIC1Q5VXU3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC40.02■■■■■ 4
CHIC1Q5VXU3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
CHIC1Q5VXU3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
CHIC1Q5VXU3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
CHIC1Q5VXU3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
CHIC1Q5VXU3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC40.01■■■■□ 3.99
CHIC1Q5VXU3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40■■■■□ 3.99
CHIC1Q5VXU3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40■■■■□ 3.99
CHIC1Q5VXU3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC40■■■■□ 3.99
CHIC1Q5VXU3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC40■■■■□ 3.99
CHIC1Q5VXU3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC39.99■■■■□ 3.99
CHIC1Q5VXU3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
CHIC1Q5VXU3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
CHIC1Q5VXU3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC39.99■■■■□ 3.99
CHIC1Q5VXU3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC39.99■■■■□ 3.99
CHIC1Q5VXU3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
CHIC1Q5VXU3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
CHIC1Q5VXU3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
CHIC1Q5VXU3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC39.98■■■■□ 3.99
CHIC1Q5VXU3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
CHIC1Q5VXU3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC39.98■■■■□ 3.99
CHIC1Q5VXU3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC39.98■■■■□ 3.99
CHIC1Q5VXU3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
CHIC1Q5VXU3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC39.97■■■■□ 3.99
CHIC1Q5VXU3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC39.97■■■■□ 3.99
CHIC1Q5VXU3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC39.97■■■■□ 3.99
CHIC1Q5VXU3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC39.97■■■■□ 3.99
CHIC1Q5VXU3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
CHIC1Q5VXU3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
CHIC1Q5VXU3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
CHIC1Q5VXU3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
CHIC1Q5VXU3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.95■■■■□ 3.99
CHIC1Q5VXU3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC39.95■■■■□ 3.99
CHIC1Q5VXU3 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC39.95■■■■□ 3.99
CHIC1Q5VXU3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC39.95■■■■□ 3.99
CHIC1Q5VXU3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
CHIC1Q5VXU3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
CHIC1Q5VXU3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
CHIC1Q5VXU3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
CHIC1Q5VXU3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
CHIC1Q5VXU3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC39.93■■■■□ 3.98
CHIC1Q5VXU3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC39.93■■■■□ 3.98
CHIC1Q5VXU3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
CHIC1Q5VXU3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC39.93■■■■□ 3.98
CHIC1Q5VXU3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC39.93■■■■□ 3.98
CHIC1Q5VXU3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
CHIC1Q5VXU3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
CHIC1Q5VXU3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
CHIC1Q5VXU3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
CHIC1Q5VXU3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.92■■■■□ 3.98
CHIC1Q5VXU3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC39.92■■■■□ 3.98
CHIC1Q5VXU3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC39.92■■■■□ 3.98
CHIC1Q5VXU3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.91■■■■□ 3.98
CHIC1Q5VXU3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
CHIC1Q5VXU3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC39.91■■■■□ 3.98
CHIC1Q5VXU3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
CHIC1Q5VXU3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
CHIC1Q5VXU3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.91■■■■□ 3.98
CHIC1Q5VXU3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC39.91■■■■□ 3.98
CHIC1Q5VXU3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC39.91■■■■□ 3.98
CHIC1Q5VXU3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC39.9■■■■□ 3.98
CHIC1Q5VXU3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
CHIC1Q5VXU3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC39.9■■■■□ 3.98
CHIC1Q5VXU3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms