Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT06

CEP350, Centrosome-associated protein 350, humanhuman

Predictions only

Length 3,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP350Q5VT06 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CEP350Q5VT06 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CEP350Q5VT06 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CEP350Q5VT06 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CEP350Q5VT06 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CEP350Q5VT06 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CEP350Q5VT06 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CEP350Q5VT06 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CEP350Q5VT06 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CEP350Q5VT06 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CEP350Q5VT06 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CEP350Q5VT06 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CEP350Q5VT06 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CEP350Q5VT06 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CEP350Q5VT06 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CEP350Q5VT06 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CEP350Q5VT06 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CEP350Q5VT06 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CEP350Q5VT06 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CEP350Q5VT06 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CEP350Q5VT06 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CEP350Q5VT06 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CEP350Q5VT06 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CEP350Q5VT06 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CEP350Q5VT06 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CEP350Q5VT06 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CEP350Q5VT06 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CEP350Q5VT06 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CEP350Q5VT06 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CEP350Q5VT06 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CEP350Q5VT06 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CEP350Q5VT06 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CEP350Q5VT06 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CEP350Q5VT06 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CEP350Q5VT06 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CEP350Q5VT06 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CEP350Q5VT06 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CEP350Q5VT06 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CEP350Q5VT06 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CEP350Q5VT06 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CEP350Q5VT06 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CEP350Q5VT06 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CEP350Q5VT06 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CEP350Q5VT06 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CEP350Q5VT06 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CEP350Q5VT06 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CEP350Q5VT06 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CEP350Q5VT06 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CEP350Q5VT06 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CEP350Q5VT06 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CEP350Q5VT06 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CEP350Q5VT06 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CEP350Q5VT06 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CEP350Q5VT06 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CEP350Q5VT06 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CEP350Q5VT06 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CEP350Q5VT06 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CEP350Q5VT06 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CEP350Q5VT06 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CEP350Q5VT06 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CEP350Q5VT06 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CEP350Q5VT06 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CEP350Q5VT06 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CEP350Q5VT06 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CEP350Q5VT06 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CEP350Q5VT06 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CEP350Q5VT06 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CEP350Q5VT06 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CEP350Q5VT06 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CEP350Q5VT06 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CEP350Q5VT06 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CEP350Q5VT06 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CEP350Q5VT06 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CEP350Q5VT06 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CEP350Q5VT06 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CEP350Q5VT06 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CEP350Q5VT06 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CEP350Q5VT06 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CEP350Q5VT06 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CEP350Q5VT06 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CEP350Q5VT06 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CEP350Q5VT06 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CEP350Q5VT06 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CEP350Q5VT06 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CEP350Q5VT06 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CEP350Q5VT06 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CEP350Q5VT06 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CEP350Q5VT06 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CEP350Q5VT06 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CEP350Q5VT06 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CEP350Q5VT06 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CEP350Q5VT06 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CEP350Q5VT06 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CEP350Q5VT06 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CEP350Q5VT06 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CEP350Q5VT06 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CEP350Q5VT06 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CEP350Q5VT06 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CEP350Q5VT06 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CEP350Q5VT06 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 517.5 ms