Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5S1

CCDC183, Coiled-coil domain-containing protein 183, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC183Q5T5S1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC183Q5T5S1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC183Q5T5S1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC183Q5T5S1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC183Q5T5S1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC183Q5T5S1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC183Q5T5S1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC183Q5T5S1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC183Q5T5S1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC183Q5T5S1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC183Q5T5S1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC183Q5T5S1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC183Q5T5S1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC183Q5T5S1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC183Q5T5S1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC183Q5T5S1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC183Q5T5S1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC183Q5T5S1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC183Q5T5S1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC183Q5T5S1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC183Q5T5S1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC183Q5T5S1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC183Q5T5S1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC183Q5T5S1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC183Q5T5S1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC183Q5T5S1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC183Q5T5S1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC183Q5T5S1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC183Q5T5S1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC183Q5T5S1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC183Q5T5S1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC183Q5T5S1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC183Q5T5S1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC183Q5T5S1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC183Q5T5S1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC183Q5T5S1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC183Q5T5S1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC183Q5T5S1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC183Q5T5S1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC183Q5T5S1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC183Q5T5S1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC183Q5T5S1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC183Q5T5S1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC183Q5T5S1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC183Q5T5S1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC183Q5T5S1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC183Q5T5S1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC183Q5T5S1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC183Q5T5S1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC183Q5T5S1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC183Q5T5S1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC183Q5T5S1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC183Q5T5S1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC183Q5T5S1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC183Q5T5S1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC183Q5T5S1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC183Q5T5S1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC183Q5T5S1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC183Q5T5S1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC183Q5T5S1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC183Q5T5S1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC183Q5T5S1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC183Q5T5S1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC183Q5T5S1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC183Q5T5S1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC183Q5T5S1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC183Q5T5S1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC183Q5T5S1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC183Q5T5S1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC183Q5T5S1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC183Q5T5S1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC183Q5T5S1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC183Q5T5S1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC183Q5T5S1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC183Q5T5S1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC183Q5T5S1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC183Q5T5S1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC183Q5T5S1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC183Q5T5S1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC183Q5T5S1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC183Q5T5S1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC183Q5T5S1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC183Q5T5S1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC183Q5T5S1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC183Q5T5S1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC183Q5T5S1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC183Q5T5S1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC183Q5T5S1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC183Q5T5S1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC183Q5T5S1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC183Q5T5S1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC183Q5T5S1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC183Q5T5S1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC183Q5T5S1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC183Q5T5S1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC183Q5T5S1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC183Q5T5S1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC183Q5T5S1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC183Q5T5S1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC183Q5T5S1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms