Protein–RNA interactions for Protein: Q5JR12

PPM1J, Protein phosphatase 1J, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPM1JQ5JR12 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PPM1JQ5JR12 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPM1JQ5JR12 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPM1JQ5JR12 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPM1JQ5JR12 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPM1JQ5JR12 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPM1JQ5JR12 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPM1JQ5JR12 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPM1JQ5JR12 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PPM1JQ5JR12 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPM1JQ5JR12 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPM1JQ5JR12 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPM1JQ5JR12 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPM1JQ5JR12 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPM1JQ5JR12 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPM1JQ5JR12 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPM1JQ5JR12 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPM1JQ5JR12 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPM1JQ5JR12 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPM1JQ5JR12 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPM1JQ5JR12 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPM1JQ5JR12 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPM1JQ5JR12 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPM1JQ5JR12 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PPM1JQ5JR12 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPM1JQ5JR12 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPM1JQ5JR12 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPM1JQ5JR12 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPM1JQ5JR12 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPM1JQ5JR12 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPM1JQ5JR12 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPM1JQ5JR12 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPM1JQ5JR12 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPM1JQ5JR12 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PPM1JQ5JR12 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPM1JQ5JR12 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPM1JQ5JR12 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPM1JQ5JR12 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPM1JQ5JR12 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPM1JQ5JR12 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPM1JQ5JR12 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPM1JQ5JR12 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPM1JQ5JR12 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPM1JQ5JR12 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPM1JQ5JR12 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPM1JQ5JR12 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPM1JQ5JR12 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPM1JQ5JR12 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPM1JQ5JR12 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPM1JQ5JR12 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPM1JQ5JR12 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPM1JQ5JR12 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPM1JQ5JR12 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPM1JQ5JR12 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPM1JQ5JR12 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PPM1JQ5JR12 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPM1JQ5JR12 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPM1JQ5JR12 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PPM1JQ5JR12 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPM1JQ5JR12 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPM1JQ5JR12 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PPM1JQ5JR12 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PPM1JQ5JR12 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PPM1JQ5JR12 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PPM1JQ5JR12 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PPM1JQ5JR12 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PPM1JQ5JR12 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPM1JQ5JR12 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPM1JQ5JR12 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPM1JQ5JR12 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPM1JQ5JR12 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PPM1JQ5JR12 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPM1JQ5JR12 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPM1JQ5JR12 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPM1JQ5JR12 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPM1JQ5JR12 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PPM1JQ5JR12 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPM1JQ5JR12 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPM1JQ5JR12 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PPM1JQ5JR12 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPM1JQ5JR12 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPM1JQ5JR12 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPM1JQ5JR12 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPM1JQ5JR12 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPM1JQ5JR12 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPM1JQ5JR12 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPM1JQ5JR12 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPM1JQ5JR12 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPM1JQ5JR12 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPM1JQ5JR12 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPM1JQ5JR12 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PPM1JQ5JR12 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPM1JQ5JR12 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPM1JQ5JR12 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPM1JQ5JR12 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPM1JQ5JR12 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PPM1JQ5JR12 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPM1JQ5JR12 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPM1JQ5JR12 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPM1JQ5JR12 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.6 ms