Protein–RNA interactions for Protein: Q53FZ2

ACSM3, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM3Q53FZ2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACSM3Q53FZ2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACSM3Q53FZ2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACSM3Q53FZ2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACSM3Q53FZ2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACSM3Q53FZ2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACSM3Q53FZ2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACSM3Q53FZ2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACSM3Q53FZ2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACSM3Q53FZ2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ACSM3Q53FZ2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACSM3Q53FZ2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACSM3Q53FZ2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACSM3Q53FZ2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACSM3Q53FZ2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACSM3Q53FZ2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACSM3Q53FZ2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACSM3Q53FZ2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ACSM3Q53FZ2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ACSM3Q53FZ2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACSM3Q53FZ2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACSM3Q53FZ2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACSM3Q53FZ2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACSM3Q53FZ2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACSM3Q53FZ2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACSM3Q53FZ2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACSM3Q53FZ2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACSM3Q53FZ2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACSM3Q53FZ2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACSM3Q53FZ2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACSM3Q53FZ2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACSM3Q53FZ2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACSM3Q53FZ2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACSM3Q53FZ2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACSM3Q53FZ2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACSM3Q53FZ2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACSM3Q53FZ2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACSM3Q53FZ2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACSM3Q53FZ2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACSM3Q53FZ2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACSM3Q53FZ2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACSM3Q53FZ2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACSM3Q53FZ2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACSM3Q53FZ2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACSM3Q53FZ2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACSM3Q53FZ2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACSM3Q53FZ2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACSM3Q53FZ2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACSM3Q53FZ2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACSM3Q53FZ2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACSM3Q53FZ2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACSM3Q53FZ2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACSM3Q53FZ2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACSM3Q53FZ2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACSM3Q53FZ2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACSM3Q53FZ2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACSM3Q53FZ2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACSM3Q53FZ2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ACSM3Q53FZ2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACSM3Q53FZ2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACSM3Q53FZ2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACSM3Q53FZ2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACSM3Q53FZ2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACSM3Q53FZ2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
ACSM3Q53FZ2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ACSM3Q53FZ2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ACSM3Q53FZ2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACSM3Q53FZ2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACSM3Q53FZ2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACSM3Q53FZ2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACSM3Q53FZ2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACSM3Q53FZ2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACSM3Q53FZ2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACSM3Q53FZ2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACSM3Q53FZ2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACSM3Q53FZ2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACSM3Q53FZ2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACSM3Q53FZ2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACSM3Q53FZ2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACSM3Q53FZ2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACSM3Q53FZ2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACSM3Q53FZ2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACSM3Q53FZ2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACSM3Q53FZ2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACSM3Q53FZ2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACSM3Q53FZ2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACSM3Q53FZ2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACSM3Q53FZ2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACSM3Q53FZ2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACSM3Q53FZ2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACSM3Q53FZ2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACSM3Q53FZ2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACSM3Q53FZ2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACSM3Q53FZ2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACSM3Q53FZ2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACSM3Q53FZ2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACSM3Q53FZ2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACSM3Q53FZ2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACSM3Q53FZ2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACSM3Q53FZ2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms