Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRNQ16849 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRNQ16849 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRNQ16849 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRNQ16849 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRNQ16849 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRNQ16849 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRNQ16849 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRNQ16849 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRNQ16849 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRNQ16849 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRNQ16849 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRNQ16849 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRNQ16849 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRNQ16849 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRNQ16849 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRNQ16849 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRNQ16849 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRNQ16849 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRNQ16849 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRNQ16849 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRNQ16849 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRNQ16849 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRNQ16849 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRNQ16849 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRNQ16849 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRNQ16849 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRNQ16849 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRNQ16849 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRNQ16849 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRNQ16849 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRNQ16849 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRNQ16849 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRNQ16849 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRNQ16849 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRNQ16849 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRNQ16849 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRNQ16849 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRNQ16849 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRNQ16849 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRNQ16849 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRNQ16849 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRNQ16849 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRNQ16849 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRNQ16849 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRNQ16849 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRNQ16849 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRNQ16849 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRNQ16849 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRNQ16849 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRNQ16849 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRNQ16849 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRNQ16849 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRNQ16849 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRNQ16849 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRNQ16849 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRNQ16849 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRNQ16849 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRNQ16849 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRNQ16849 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRNQ16849 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRNQ16849 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRNQ16849 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRNQ16849 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRNQ16849 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRNQ16849 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRNQ16849 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRNQ16849 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRNQ16849 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRNQ16849 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PTPRNQ16849 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PTPRNQ16849 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PTPRNQ16849 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRNQ16849 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRNQ16849 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRNQ16849 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRNQ16849 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRNQ16849 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRNQ16849 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRNQ16849 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRNQ16849 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRNQ16849 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRNQ16849 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRNQ16849 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRNQ16849 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRNQ16849 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRNQ16849 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRNQ16849 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRNQ16849 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRNQ16849 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRNQ16849 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRNQ16849 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRNQ16849 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRNQ16849 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRNQ16849 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRNQ16849 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRNQ16849 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRNQ16849 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRNQ16849 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRNQ16849 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
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