Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LAMA3Q16787 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LAMA3Q16787 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LAMA3Q16787 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
LAMA3Q16787 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
LAMA3Q16787 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LAMA3Q16787 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LAMA3Q16787 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LAMA3Q16787 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LAMA3Q16787 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LAMA3Q16787 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LAMA3Q16787 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LAMA3Q16787 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LAMA3Q16787 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LAMA3Q16787 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LAMA3Q16787 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LAMA3Q16787 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LAMA3Q16787 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LAMA3Q16787 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LAMA3Q16787 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
LAMA3Q16787 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
LAMA3Q16787 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
LAMA3Q16787 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LAMA3Q16787 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LAMA3Q16787 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LAMA3Q16787 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LAMA3Q16787 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LAMA3Q16787 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LAMA3Q16787 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
LAMA3Q16787 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LAMA3Q16787 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LAMA3Q16787 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LAMA3Q16787 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LAMA3Q16787 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMA3Q16787 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMA3Q16787 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMA3Q16787 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMA3Q16787 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LAMA3Q16787 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LAMA3Q16787 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LAMA3Q16787 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LAMA3Q16787 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LAMA3Q16787 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LAMA3Q16787 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LAMA3Q16787 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LAMA3Q16787 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LAMA3Q16787 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LAMA3Q16787 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LAMA3Q16787 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LAMA3Q16787 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LAMA3Q16787 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LAMA3Q16787 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LAMA3Q16787 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LAMA3Q16787 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LAMA3Q16787 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LAMA3Q16787 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LAMA3Q16787 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LAMA3Q16787 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LAMA3Q16787 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LAMA3Q16787 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LAMA3Q16787 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LAMA3Q16787 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LAMA3Q16787 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
LAMA3Q16787 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
LAMA3Q16787 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
LAMA3Q16787 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
LAMA3Q16787 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LAMA3Q16787 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LAMA3Q16787 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
LAMA3Q16787 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
LAMA3Q16787 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
LAMA3Q16787 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
LAMA3Q16787 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LAMA3Q16787 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LAMA3Q16787 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LAMA3Q16787 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LAMA3Q16787 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LAMA3Q16787 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LAMA3Q16787 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LAMA3Q16787 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LAMA3Q16787 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LAMA3Q16787 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LAMA3Q16787 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
LAMA3Q16787 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LAMA3Q16787 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LAMA3Q16787 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
LAMA3Q16787 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LAMA3Q16787 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LAMA3Q16787 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LAMA3Q16787 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
LAMA3Q16787 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LAMA3Q16787 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LAMA3Q16787 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LAMA3Q16787 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LAMA3Q16787 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LAMA3Q16787 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
LAMA3Q16787 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
LAMA3Q16787 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
LAMA3Q16787 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LAMA3Q16787 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
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