Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LSAMPQ13449 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LSAMPQ13449 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LSAMPQ13449 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LSAMPQ13449 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LSAMPQ13449 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LSAMPQ13449 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LSAMPQ13449 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LSAMPQ13449 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LSAMPQ13449 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LSAMPQ13449 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LSAMPQ13449 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LSAMPQ13449 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LSAMPQ13449 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LSAMPQ13449 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LSAMPQ13449 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LSAMPQ13449 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LSAMPQ13449 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LSAMPQ13449 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LSAMPQ13449 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LSAMPQ13449 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LSAMPQ13449 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LSAMPQ13449 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LSAMPQ13449 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LSAMPQ13449 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LSAMPQ13449 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LSAMPQ13449 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LSAMPQ13449 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LSAMPQ13449 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LSAMPQ13449 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LSAMPQ13449 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LSAMPQ13449 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LSAMPQ13449 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LSAMPQ13449 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LSAMPQ13449 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LSAMPQ13449 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LSAMPQ13449 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LSAMPQ13449 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LSAMPQ13449 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LSAMPQ13449 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LSAMPQ13449 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LSAMPQ13449 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LSAMPQ13449 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LSAMPQ13449 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LSAMPQ13449 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LSAMPQ13449 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LSAMPQ13449 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LSAMPQ13449 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LSAMPQ13449 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LSAMPQ13449 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LSAMPQ13449 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LSAMPQ13449 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LSAMPQ13449 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LSAMPQ13449 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LSAMPQ13449 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LSAMPQ13449 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LSAMPQ13449 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LSAMPQ13449 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LSAMPQ13449 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LSAMPQ13449 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LSAMPQ13449 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LSAMPQ13449 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LSAMPQ13449 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LSAMPQ13449 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LSAMPQ13449 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LSAMPQ13449 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LSAMPQ13449 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LSAMPQ13449 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LSAMPQ13449 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LSAMPQ13449 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LSAMPQ13449 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LSAMPQ13449 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LSAMPQ13449 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LSAMPQ13449 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LSAMPQ13449 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LSAMPQ13449 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LSAMPQ13449 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LSAMPQ13449 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LSAMPQ13449 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LSAMPQ13449 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LSAMPQ13449 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LSAMPQ13449 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LSAMPQ13449 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LSAMPQ13449 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LSAMPQ13449 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LSAMPQ13449 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LSAMPQ13449 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LSAMPQ13449 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LSAMPQ13449 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LSAMPQ13449 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LSAMPQ13449 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LSAMPQ13449 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LSAMPQ13449 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LSAMPQ13449 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LSAMPQ13449 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LSAMPQ13449 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LSAMPQ13449 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LSAMPQ13449 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LSAMPQ13449 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LSAMPQ13449 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
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