Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRAF1Q13077 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
TRAF1Q13077 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRAF1Q13077 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRAF1Q13077 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRAF1Q13077 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRAF1Q13077 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
TRAF1Q13077 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRAF1Q13077 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRAF1Q13077 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRAF1Q13077 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRAF1Q13077 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TRAF1Q13077 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TRAF1Q13077 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
TRAF1Q13077 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TRAF1Q13077 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
TRAF1Q13077 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAF1Q13077 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAF1Q13077 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAF1Q13077 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAF1Q13077 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAF1Q13077 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAF1Q13077 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAF1Q13077 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRAF1Q13077 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRAF1Q13077 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRAF1Q13077 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRAF1Q13077 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRAF1Q13077 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRAF1Q13077 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRAF1Q13077 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRAF1Q13077 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRAF1Q13077 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRAF1Q13077 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRAF1Q13077 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRAF1Q13077 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRAF1Q13077 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRAF1Q13077 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRAF1Q13077 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRAF1Q13077 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRAF1Q13077 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRAF1Q13077 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRAF1Q13077 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRAF1Q13077 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRAF1Q13077 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRAF1Q13077 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRAF1Q13077 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRAF1Q13077 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRAF1Q13077 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRAF1Q13077 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRAF1Q13077 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRAF1Q13077 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRAF1Q13077 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRAF1Q13077 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRAF1Q13077 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRAF1Q13077 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRAF1Q13077 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
TRAF1Q13077 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRAF1Q13077 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRAF1Q13077 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRAF1Q13077 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRAF1Q13077 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRAF1Q13077 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TRAF1Q13077 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRAF1Q13077 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRAF1Q13077 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRAF1Q13077 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRAF1Q13077 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRAF1Q13077 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRAF1Q13077 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRAF1Q13077 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRAF1Q13077 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRAF1Q13077 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRAF1Q13077 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRAF1Q13077 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
TRAF1Q13077 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRAF1Q13077 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
TRAF1Q13077 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRAF1Q13077 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRAF1Q13077 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRAF1Q13077 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRAF1Q13077 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRAF1Q13077 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRAF1Q13077 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRAF1Q13077 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRAF1Q13077 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRAF1Q13077 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRAF1Q13077 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TRAF1Q13077 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRAF1Q13077 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRAF1Q13077 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRAF1Q13077 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRAF1Q13077 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRAF1Q13077 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRAF1Q13077 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRAF1Q13077 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRAF1Q13077 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRAF1Q13077 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRAF1Q13077 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRAF1Q13077 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
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