Protein–RNA interactions for Protein: Q12316

TY1B-GR3, Transposon Ty1-GR3 Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-GR3Q12316 YAR066WYAR066W 612 nt7.97□□□□□ -1.13
TY1B-GR3Q12316 THI4YGR144W 981 nt7.96□□□□□ -1.14
TY1B-GR3Q12316 DCI1YOR180C 816 nt7.96□□□□□ -1.14
TY1B-GR3Q12316 MRL1YPR079W 1146 nt7.96□□□□□ -1.14
TY1B-GR3Q12316 YDL027CYDL027C 1263 nt7.95□□□□□ -1.14
TY1B-GR3Q12316 TRP5YGL026C 2124 nt7.95□□□□□ -1.14
TY1B-GR3Q12316 CUE5YOR042W 1236 nt7.95□□□□□ -1.14
TY1B-GR3Q12316 MRC1YCL061C 3291 nt7.95□□□□□ -1.14
TY1B-GR3Q12316 SER33YIL074C 1410 nt7.94□□□□□ -1.14
TY1B-GR3Q12316 AVT3YKL146W 2079 nt7.94□□□□□ -1.14
TY1B-GR3Q12316 YDR541CYDR541C 1035 nt7.94□□□□□ -1.14
TY1B-GR3Q12316 RPL21BYPL079W 483 nt7.94□□□□□ -1.14
TY1B-GR3Q12316 ADE4YMR300C 1533 nt7.93□□□□□ -1.14
TY1B-GR3Q12316 TOM71YHR117W 1920 nt7.93□□□□□ -1.14
TY1B-GR3Q12316 APN1YKL114C 1104 nt7.93□□□□□ -1.14
TY1B-GR3Q12316 YNL057WYNL057W 333 nt7.93□□□□□ -1.14
TY1B-GR3Q12316 MF(ALPHA)2YGL089C 363 nt7.92□□□□□ -1.14
TY1B-GR3Q12316 PEX22YAL055W 543 nt7.92□□□□□ -1.14
TY1B-GR3Q12316 YNL134CYNL134C 1131 nt7.92□□□□□ -1.14
TY1B-GR3Q12316 PAT1YCR077C 2391 nt7.91□□□□□ -1.14
TY1B-GR3Q12316 HSP31YDR533C 714 nt7.9□□□□□ -1.14
TY1B-GR3Q12316 YGR035W-AYGR035W-A 222 nt7.9□□□□□ -1.14
TY1B-GR3Q12316 TYS1YGR185C 1185 nt7.9□□□□□ -1.14
TY1B-GR3Q12316 MND2YIR025W 1107 nt7.9□□□□□ -1.14
TY1B-GR3Q12316 ACS2YLR153C 2052 nt7.9□□□□□ -1.14
TY1B-GR3Q12316 GEP5YLR091W 882 nt7.89□□□□□ -1.15
TY1B-GR3Q12316 QRI1YDL103C 1434 nt7.89□□□□□ -1.15
TY1B-GR3Q12316 ASH1YKL185W 1767 nt7.89□□□□□ -1.15
TY1B-GR3Q12316 NOT3YIL038C 2511 nt7.89□□□□□ -1.15
TY1B-GR3Q12316 YNK1YKL067W 462 nt7.88□□□□□ -1.15
TY1B-GR3Q12316 VPS4YPR173C 1314 nt7.88□□□□□ -1.15
TY1B-GR3Q12316 DBR1YKL149C 1218 nt7.87□□□□□ -1.15
TY1B-GR3Q12316 ENT2YLR206W 1842 nt7.87□□□□□ -1.15
TY1B-GR3Q12316 PRS1YKL181W 1284 nt7.87□□□□□ -1.15
TY1B-GR3Q12316 NTH2YBR001C 2343 nt7.86□□□□□ -1.15
TY1B-GR3Q12316 AFG2YLR397C 2343 nt7.85□□□□□ -1.15
TY1B-GR3Q12316 VMA13YPR036W 1437 nt7.85□□□□□ -1.15
TY1B-GR3Q12316 GAL10YBR019C 2100 nt7.85□□□□□ -1.15
TY1B-GR3Q12316 YAP1802YGR241C 1707 nt7.85□□□□□ -1.15
TY1B-GR3Q12316 MRM2YGL136C 963 nt7.85□□□□□ -1.15
TY1B-GR3Q12316 YAL044W-AYAL044W-A 333 nt7.85□□□□□ -1.15
TY1B-GR3Q12316 MRPL39YML009C 213 nt7.85□□□□□ -1.15
TY1B-GR3Q12316 PDB1YBR221C 1101 nt7.85□□□□□ -1.15
TY1B-GR3Q12316 SLX5YDL013W 1860 nt7.84□□□□□ -1.15
TY1B-GR3Q12316 YDR133CYDR133C 336 nt7.84□□□□□ -1.15
TY1B-GR3Q12316 YKE4YIL023C 1041 nt7.84□□□□□ -1.15
TY1B-GR3Q12316 ATG14YBR128C 1035 nt7.84□□□□□ -1.15
TY1B-GR3Q12316 PRR1YKL116C 1557 nt7.84□□□□□ -1.15
TY1B-GR3Q12316 HXT13YEL069C 1695 nt7.84□□□□□ -1.16
TY1B-GR3Q12316 ERG12YMR208W 1332 nt7.83□□□□□ -1.16
TY1B-GR3Q12316 IMA5YJL216C 1746 nt7.83□□□□□ -1.16
TY1B-GR3Q12316 YBL010CYBL010C 843 nt7.83□□□□□ -1.16
TY1B-GR3Q12316 PRP2YNR011C 2631 nt7.83□□□□□ -1.16
TY1B-GR3Q12316 CAB1YDR531W 1104 nt7.82□□□□□ -1.16
TY1B-GR3Q12316 BNA6YFR047C 888 nt7.82□□□□□ -1.16
TY1B-GR3Q12316 YPT32YGL210W 669 nt7.82□□□□□ -1.16
TY1B-GR3Q12316 LPL1YOR059C 1353 nt7.82□□□□□ -1.16
TY1B-GR3Q12316 SPS19YNL202W 879 nt7.82□□□□□ -1.16
TY1B-GR3Q12316 GPM3YOL056W 912 nt7.81□□□□□ -1.16
TY1B-GR3Q12316 PRM1YNL279W 1986 nt7.8□□□□□ -1.16
TY1B-GR3Q12316 STF1YDL130W-A 261 nt7.8□□□□□ -1.16
TY1B-GR3Q12316 ACP1YKL192C 378 nt7.8□□□□□ -1.16
TY1B-GR3Q12316 SSK1YLR006C 2139 nt7.8□□□□□ -1.16
TY1B-GR3Q12316 DOA1YKL213C 2148 nt7.8□□□□□ -1.16
TY1B-GR3Q12316 PUS6YGR169C 1215 nt7.79□□□□□ -1.16
TY1B-GR3Q12316 YLR317WYLR317W 435 nt7.79□□□□□ -1.16
TY1B-GR3Q12316 SPN1YPR133C 1233 nt7.79□□□□□ -1.16
TY1B-GR3Q12316 HXT5YHR096C 1779 nt7.79□□□□□ -1.16
TY1B-GR3Q12316 ATP1YBL099W 1638 nt7.79□□□□□ -1.16
TY1B-GR3Q12316 NSE5YML023C 1671 nt7.79□□□□□ -1.16
TY1B-GR3Q12316 SAC6YDR129C 1929 nt7.78□□□□□ -1.16
TY1B-GR3Q12316 YNL217WYNL217W 981 nt7.78□□□□□ -1.16
TY1B-GR3Q12316 MAP2YBL091C 1266 nt7.78□□□□□ -1.16
TY1B-GR3Q12316 HEM14YER014W 1620 nt7.78□□□□□ -1.16
TY1B-GR3Q12316 MKS1YNL076W 1755 nt7.78□□□□□ -1.16
TY1B-GR3Q12316 BUD7YOR299W 2241 nt7.78□□□□□ -1.16
TY1B-GR3Q12316 YEF1YEL041W 1488 nt7.77□□□□□ -1.16
TY1B-GR3Q12316 RAD57YDR004W 1383 nt7.77□□□□□ -1.17
TY1B-GR3Q12316 EXO70YJL085W 1872 nt7.77□□□□□ -1.17
TY1B-GR3Q12316 NSG1YHR133C 876 nt7.76□□□□□ -1.17
TY1B-GR3Q12316 RHO4YKR055W 876 nt7.76□□□□□ -1.17
TY1B-GR3Q12316 YLR157W-DYLR157W-D 213 nt7.76□□□□□ -1.17
TY1B-GR3Q12316 GUA1YMR217W 1578 nt7.76□□□□□ -1.17
TY1B-GR3Q12316 YIL108WYIL108W 2091 nt7.76□□□□□ -1.17
TY1B-GR3Q12316 QDR1YIL120W 1692 nt7.76□□□□□ -1.17
TY1B-GR3Q12316 FRT1YOR324C 1809 nt7.75□□□□□ -1.17
TY1B-GR3Q12316 YKR041WYKR041W 753 nt7.75□□□□□ -1.17
TY1B-GR3Q12316 UTP18YJL069C 1785 nt7.75□□□□□ -1.17
TY1B-GR3Q12316 KEL1YHR158C 3495 nt7.75□□□□□ -1.17
TY1B-GR3Q12316 YAR023CYAR023C 540 nt7.74□□□□□ -1.17
TY1B-GR3Q12316 POP3YNL282W 588 nt7.74□□□□□ -1.17
TY1B-GR3Q12316 YOL131WYOL131W 327 nt7.74□□□□□ -1.17
TY1B-GR3Q12316 PIF1YML061C 2580 nt7.74□□□□□ -1.17
TY1B-GR3Q12316 SCO1YBR037C 888 nt7.74□□□□□ -1.17
TY1B-GR3Q12316 PDH1YPR002W 1551 nt7.73□□□□□ -1.17
TY1B-GR3Q12316 YMR027WYMR027W 1413 nt7.73□□□□□ -1.17
TY1B-GR3Q12316 SIF2YBR103W 1608 nt7.73□□□□□ -1.17
TY1B-GR3Q12316 ATE1YGL017W 1512 nt7.72□□□□□ -1.17
TY1B-GR3Q12316 CTF3YLR381W 2202 nt7.72□□□□□ -1.17
TY1B-GR3Q12316 MDG1YNL173C 1101 nt7.72□□□□□ -1.17
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