Protein–RNA interactions for Protein: Q08109

HRD1, ERAD-associated E3 ubiquitin-protein ligase HRD1, yeastyeast

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HRD1Q08109 SEC20YDR498C 1152 nt4.73□□□□□ -1.65
HRD1Q08109 YHR182WYHR182W 2358 nt4.72□□□□□ -1.65
HRD1Q08109 GYP1YOR070C 1914 nt4.72□□□□□ -1.65
HRD1Q08109 YER084WYER084W 387 nt4.72□□□□□ -1.65
HRD1Q08109 APS3YJL024C 585 nt4.72□□□□□ -1.65
HRD1Q08109 MOG1YJR074W 657 nt4.72□□□□□ -1.65
HRD1Q08109 SFC1YJR095W 969 nt4.72□□□□□ -1.65
HRD1Q08109 ASK1YKL052C 879 nt4.72□□□□□ -1.65
HRD1Q08109 PRS1YKL181W 1284 nt4.72□□□□□ -1.65
HRD1Q08109 RHO2YNL090W 579 nt4.72□□□□□ -1.65
HRD1Q08109 PSH1YOL054W 1221 nt4.72□□□□□ -1.65
HRD1Q08109 RPS9AYPL081W 594 nt4.72□□□□□ -1.65
HRD1Q08109 COX11YPL132W 903 nt4.72□□□□□ -1.65
HRD1Q08109 EEB1YPL095C 1371 nt4.72□□□□□ -1.65
HRD1Q08109 SNT2YGL131C 4212 nt4.72□□□□□ -1.65
HRD1Q08109 DRS1YLL008W 2259 nt4.71□□□□□ -1.65
HRD1Q08109 TUP1YCR084C 2142 nt4.71□□□□□ -1.66
HRD1Q08109 ATO3YDR384C 828 nt4.71□□□□□ -1.66
HRD1Q08109 HCR1YLR192C 798 nt4.71□□□□□ -1.66
HRD1Q08109 HOR7YMR251W-A 180 nt4.71□□□□□ -1.66
HRD1Q08109 RPS15YOL040C 429 nt4.71□□□□□ -1.66
HRD1Q08109 AAD15YOL165C 432 nt4.71□□□□□ -1.66
HRD1Q08109 RBD2YPL246C 789 nt4.71□□□□□ -1.66
HRD1Q08109 ADE13YLR359W 1449 nt4.71□□□□□ -1.66
HRD1Q08109 STE20YHL007C 2820 nt4.7□□□□□ -1.66
HRD1Q08109 PEX19YDL065C 1029 nt4.7□□□□□ -1.66
HRD1Q08109 YDL114WYDL114W 927 nt4.7□□□□□ -1.66
HRD1Q08109 VCX1YDL128W 1236 nt4.7□□□□□ -1.66
HRD1Q08109 HEM3YDL205C 984 nt4.7□□□□□ -1.66
HRD1Q08109 ECT1YGR007W 972 nt4.7□□□□□ -1.66
HRD1Q08109 CAX4YGR036C 720 nt4.7□□□□□ -1.66
HRD1Q08109 YIL060WYIL060W 435 nt4.7□□□□□ -1.66
HRD1Q08109 CSG2YBR036C 1233 nt4.7□□□□□ -1.66
HRD1Q08109 ENV7YPL236C 1095 nt4.7□□□□□ -1.66
HRD1Q08109 ASF2YDL197C 1578 nt4.7□□□□□ -1.66
HRD1Q08109 SSK22YCR073C 3996 nt4.69□□□□□ -1.66
HRD1Q08109 ZRT2YLR130C 1269 nt4.69□□□□□ -1.66
HRD1Q08109 IMD1YAR073W 1212 nt4.69□□□□□ -1.66
HRD1Q08109 TUL1YKL034W 2277 nt4.69□□□□□ -1.66
HRD1Q08109 GDB1YPR184W 4611 nt4.68□□□□□ -1.66
HRD1Q08109 COR1YBL045C 1374 nt4.68□□□□□ -1.66
HRD1Q08109 GAL83YER027C 1254 nt4.68□□□□□ -1.66
HRD1Q08109 ADE6YGR061C 4077 nt4.68□□□□□ -1.66
HRD1Q08109 TOS3YGL179C 1683 nt4.67□□□□□ -1.66
HRD1Q08109 STL1YDR536W 1710 nt4.67□□□□□ -1.66
HRD1Q08109 MAK32YCR019W 1092 nt4.67□□□□□ -1.66
HRD1Q08109 UGX2YDL169C 672 nt4.67□□□□□ -1.66
HRD1Q08109 YEA6YEL006W 1008 nt4.67□□□□□ -1.66
HRD1Q08109 RRP4YHR069C 1080 nt4.67□□□□□ -1.66
HRD1Q08109 ATG12YBR217W 561 nt4.67□□□□□ -1.66
HRD1Q08109 UTP18YJL069C 1785 nt4.67□□□□□ -1.66
HRD1Q08109 PRP46YPL151C 1356 nt4.66□□□□□ -1.66
HRD1Q08109 PDR10YOR328W 4695 nt4.66□□□□□ -1.66
HRD1Q08109 HAP1YLR256W 4509 nt4.66□□□□□ -1.66
HRD1Q08109 YCL065WYCL065W 369 nt4.66□□□□□ -1.66
HRD1Q08109 YFR035CYFR035C 345 nt4.66□□□□□ -1.66
HRD1Q08109 RFA1YAR007C 1866 nt4.66□□□□□ -1.66
HRD1Q08109 PXA1YPL147W 2613 nt4.66□□□□□ -1.66
HRD1Q08109 MRK1YDL079C 1506 nt4.66□□□□□ -1.66
HRD1Q08109 BAP2YBR068C 1830 nt4.65□□□□□ -1.66
HRD1Q08109 YRA1YDR381W 681 nt4.65□□□□□ -1.67
HRD1Q08109 POR2YIL114C 846 nt4.65□□□□□ -1.67
HRD1Q08109 PGA2YNL149C 390 nt4.65□□□□□ -1.67
HRD1Q08109 ASH1YKL185W 1767 nt4.65□□□□□ -1.67
HRD1Q08109 SNF3YDL194W 2655 nt4.65□□□□□ -1.67
HRD1Q08109 YIL067CYIL067C 2037 nt4.65□□□□□ -1.67
HRD1Q08109 TEF1YPR080W 1377 nt4.65□□□□□ -1.67
HRD1Q08109 TEF2YBR118W 1377 nt4.65□□□□□ -1.67
HRD1Q08109 AFT1YGL071W 2073 nt4.65□□□□□ -1.67
HRD1Q08109 NOC4YPR144C 1659 nt4.64□□□□□ -1.67
HRD1Q08109 YDL022C-AYDL022C-A 249 nt4.64□□□□□ -1.67
HRD1Q08109 RPT6YGL048C 1218 nt4.64□□□□□ -1.67
HRD1Q08109 PRE3YJL001W 648 nt4.64□□□□□ -1.67
HRD1Q08109 YKL031WYKL031W 414 nt4.64□□□□□ -1.67
HRD1Q08109 YKR073CYKR073C 321 nt4.64□□□□□ -1.67
HRD1Q08109 HLJ1YMR161W 675 nt4.64□□□□□ -1.67
HRD1Q08109 YPR098CYPR098C 486 nt4.64□□□□□ -1.67
HRD1Q08109 PHO90YJL198W 2646 nt4.64□□□□□ -1.67
HRD1Q08109 MNS1YJR131W 1650 nt4.64□□□□□ -1.67
HRD1Q08109 ELP3YPL086C 1674 nt4.64□□□□□ -1.67
HRD1Q08109 YTA6YPL074W 2265 nt4.63□□□□□ -1.67
HRD1Q08109 NUD1YOR373W 2556 nt4.63□□□□□ -1.67
HRD1Q08109 GPR1YDL035C 2886 nt4.63□□□□□ -1.67
HRD1Q08109 BUL1YMR275C 2931 nt4.63□□□□□ -1.67
HRD1Q08109 KCH1YJR054W 1494 nt4.63□□□□□ -1.67
HRD1Q08109 PDE1YGL248W 1110 nt4.63□□□□□ -1.67
HRD1Q08109 DOM34YNL001W 1161 nt4.63□□□□□ -1.67
HRD1Q08109 SEC9YGR009C 1956 nt4.63□□□□□ -1.67
HRD1Q08109 BPL1YDL141W 2073 nt4.63□□□□□ -1.67
HRD1Q08109 SPC97YHR172W 2472 nt4.63□□□□□ -1.67
HRD1Q08109 HPF1YOL155C 2904 nt4.62□□□□□ -1.67
HRD1Q08109 DFM1YDR411C 1026 nt4.62□□□□□ -1.67
HRD1Q08109 CDC43YGL155W 1131 nt4.62□□□□□ -1.67
HRD1Q08109 RPR2YIR015W 435 nt4.62□□□□□ -1.67
HRD1Q08109 TRK2YKR050W 2670 nt4.62□□□□□ -1.67
HRD1Q08109 SIA1YOR137C 1869 nt4.62□□□□□ -1.67
HRD1Q08109 SEC12YNR026C 1416 nt4.62□□□□□ -1.67
HRD1Q08109 ASK10YGR097W 3441 nt4.61□□□□□ -1.67
HRD1Q08109 URA3YEL021W 804 nt4.61□□□□□ -1.67
HRD1Q08109 PRS2YER099C 957 nt4.61□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 45.9 ms