Protein–RNA interactions for Protein: Q03973

HMO1, High mobility group protein 1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HMO1Q03973 EPS1YIL005W 2106 nt5.9□□□□□ -1.46
HMO1Q03973 FAT3YKL187C 2253 nt5.9□□□□□ -1.46
HMO1Q03973 ATP1YBL099W 1638 nt5.9□□□□□ -1.46
HMO1Q03973 YER148W-AYER148W-A 579 nt5.9□□□□□ -1.46
HMO1Q03973 YJR084WYJR084W 1272 nt5.9□□□□□ -1.46
HMO1Q03973 BLS1YLR408C 369 nt5.9□□□□□ -1.46
HMO1Q03973 MSN2YMR037C 2115 nt5.9□□□□□ -1.47
HMO1Q03973 HIR1YBL008W 2523 nt5.9□□□□□ -1.47
HMO1Q03973 ZWF1YNL241C 1518 nt5.89□□□□□ -1.47
HMO1Q03973 IPI3YNL182C 1668 nt5.89□□□□□ -1.47
HMO1Q03973 YEH1YLL012W 1722 nt5.89□□□□□ -1.47
HMO1Q03973 YDL023CYDL023C 321 nt5.89□□□□□ -1.47
HMO1Q03973 UPS3YDR185C 540 nt5.89□□□□□ -1.47
HMO1Q03973 YDR541CYDR541C 1035 nt5.89□□□□□ -1.47
HMO1Q03973 YER186CYER186C 921 nt5.89□□□□□ -1.47
HMO1Q03973 LCL3YGL085W 825 nt5.89□□□□□ -1.47
HMO1Q03973 SAY1YGR263C 1275 nt5.89□□□□□ -1.47
HMO1Q03973 tR(ACG)DtR(ACG)D 73 nt5.89□□□□□ -1.47
HMO1Q03973 tR(ACG)EtR(ACG)E 73 nt5.89□□□□□ -1.47
HMO1Q03973 tR(ACG)KtR(ACG)K 73 nt5.89□□□□□ -1.47
HMO1Q03973 tR(ACG)LtR(ACG)L 73 nt5.89□□□□□ -1.47
HMO1Q03973 tR(ACG)OtR(ACG)O 73 nt5.89□□□□□ -1.47
HMO1Q03973 YLR198CYLR198C 360 nt5.89□□□□□ -1.47
HMO1Q03973 TSA1YML028W 591 nt5.89□□□□□ -1.47
HMO1Q03973 YOL038C-AYOL038C-A 96 nt5.89□□□□□ -1.47
HMO1Q03973 YOR020W-AYOR020W-A 273 nt5.89□□□□□ -1.47
HMO1Q03973 GPD2YOL059W 1323 nt5.89□□□□□ -1.47
HMO1Q03973 VPS70YJR126C 2436 nt5.89□□□□□ -1.47
HMO1Q03973 TKL1YPR074C 2043 nt5.89□□□□□ -1.47
HMO1Q03973 YLL067CYLL067C 3618 nt5.88□□□□□ -1.47
HMO1Q03973 GEX1YCL073C 1848 nt5.88□□□□□ -1.47
HMO1Q03973 GEX2YKR106W 1848 nt5.88□□□□□ -1.47
HMO1Q03973 MRPL35YDR322W 1104 nt5.88□□□□□ -1.47
HMO1Q03973 ADH4YGL256W 1149 nt5.88□□□□□ -1.47
HMO1Q03973 MRP13YGR084C 1020 nt5.88□□□□□ -1.47
HMO1Q03973 YKR104WYKR104W 921 nt5.88□□□□□ -1.47
HMO1Q03973 TAF9YMR236W 474 nt5.88□□□□□ -1.47
HMO1Q03973 VPS28YPL065W 729 nt5.88□□□□□ -1.47
HMO1Q03973 MRP51YPL118W 1035 nt5.88□□□□□ -1.47
HMO1Q03973 RIM101YHL027W 1878 nt5.88□□□□□ -1.47
HMO1Q03973 GSY2YLR258W 2118 nt5.87□□□□□ -1.47
HMO1Q03973 GPB2YAL056W 2643 nt5.87□□□□□ -1.47
HMO1Q03973 IDP1YDL066W 1287 nt5.87□□□□□ -1.47
HMO1Q03973 IRC7YFR055W 1023 nt5.87□□□□□ -1.47
HMO1Q03973 SKI8YGL213C 1194 nt5.87□□□□□ -1.47
HMO1Q03973 HAP2YGL237C 798 nt5.87□□□□□ -1.47
HMO1Q03973 WSS1YHR134W 810 nt5.87□□□□□ -1.47
HMO1Q03973 YBL029WYBL029W 1131 nt5.87□□□□□ -1.47
HMO1Q03973 RPC19YNL113W 429 nt5.87□□□□□ -1.47
HMO1Q03973 BAG7YOR134W 1230 nt5.87□□□□□ -1.47
HMO1Q03973 CWC27YPL064C 906 nt5.87□□□□□ -1.47
HMO1Q03973 YMR279CYMR279C 1623 nt5.87□□□□□ -1.47
HMO1Q03973 ERC1YHR032W 1746 nt5.87□□□□□ -1.47
HMO1Q03973 IRS4YKR019C 1848 nt5.86□□□□□ -1.47
HMO1Q03973 RAD59YDL059C 717 nt5.86□□□□□ -1.47
HMO1Q03973 ERG26YGL001C 1050 nt5.86□□□□□ -1.47
HMO1Q03973 RPS2YGL123W 765 nt5.86□□□□□ -1.47
HMO1Q03973 MHT1YLL062C 975 nt5.86□□□□□ -1.47
HMO1Q03973 CKS1YBR135W 453 nt5.86□□□□□ -1.47
HMO1Q03973 IMA2YOL157C 1770 nt5.85□□□□□ -1.47
HMO1Q03973 HSF1YGL073W 2502 nt5.85□□□□□ -1.47
HMO1Q03973 GPT2YKR067W 2232 nt5.85□□□□□ -1.47
HMO1Q03973 STD1YOR047C 1335 nt5.85□□□□□ -1.47
HMO1Q03973 SIP2YGL208W 1248 nt5.85□□□□□ -1.47
HMO1Q03973 OKP1YGR179C 1221 nt5.85□□□□□ -1.47
HMO1Q03973 ECM14YHR132C 1293 nt5.85□□□□□ -1.47
HMO1Q03973 YLL059CYLL059C 507 nt5.85□□□□□ -1.47
HMO1Q03973 GLC8YMR311C 690 nt5.85□□□□□ -1.47
HMO1Q03973 POR1YNL055C 852 nt5.85□□□□□ -1.47
HMO1Q03973 MRPS18YNL306W 654 nt5.85□□□□□ -1.47
HMO1Q03973 YPK2YMR104C 2034 nt5.84□□□□□ -1.47
HMO1Q03973 ENT2YLR206W 1842 nt5.84□□□□□ -1.47
HMO1Q03973 SPG1YGR236C 288 nt5.84□□□□□ -1.47
HMO1Q03973 OM45YIL136W 1182 nt5.84□□□□□ -1.47
HMO1Q03973 LDS1YAL018C 978 nt5.84□□□□□ -1.47
HMO1Q03973 SRY1YKL218C 981 nt5.84□□□□□ -1.47
HMO1Q03973 YLR296WYLR296W 327 nt5.84□□□□□ -1.47
HMO1Q03973 IRC14YOR135C 342 nt5.84□□□□□ -1.47
HMO1Q03973 TFB4YPR056W 1017 nt5.84□□□□□ -1.47
HMO1Q03973 SCT1YBL011W 2280 nt5.84□□□□□ -1.47
HMO1Q03973 RNR3YIL066C 2610 nt5.84□□□□□ -1.47
HMO1Q03973 CRF1YDR223W 1404 nt5.83□□□□□ -1.48
HMO1Q03973 YDL057WYDL057W 987 nt5.83□□□□□ -1.48
HMO1Q03973 TIM22YDL217C 624 nt5.83□□□□□ -1.48
HMO1Q03973 RME1YGR044C 903 nt5.83□□□□□ -1.48
HMO1Q03973 SPO16YHR153C 597 nt5.83□□□□□ -1.48
HMO1Q03973 YKR045CYKR045C 552 nt5.83□□□□□ -1.48
HMO1Q03973 HSP104YLL026W 2727 nt5.83□□□□□ -1.48
HMO1Q03973 SRV2YNL138W 1581 nt5.83□□□□□ -1.48
HMO1Q03973 FLC3YGL139W 2409 nt5.83□□□□□ -1.48
HMO1Q03973 DIA3YDL024C 1407 nt5.82□□□□□ -1.48
HMO1Q03973 ASN1YPR145W 1719 nt5.82□□□□□ -1.48
HMO1Q03973 PYC1YGL062W 3537 nt5.82□□□□□ -1.48
HMO1Q03973 SDH4YDR178W 546 nt5.82□□□□□ -1.48
HMO1Q03973 YEL068CYEL068C 333 nt5.82□□□□□ -1.48
HMO1Q03973 YER138W-AYER138W-A 105 nt5.82□□□□□ -1.48
HMO1Q03973 GCG1YER163C 699 nt5.82□□□□□ -1.48
HMO1Q03973 YGR011WYGR011W 327 nt5.82□□□□□ -1.48
HMO1Q03973 AAT2YLR027C 1257 nt5.82□□□□□ -1.48
HMO1Q03973 GEP5YLR091W 882 nt5.82□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13 ms