Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CNTN2Q02246 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CNTN2Q02246 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CNTN2Q02246 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CNTN2Q02246 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CNTN2Q02246 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CNTN2Q02246 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CNTN2Q02246 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CNTN2Q02246 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CNTN2Q02246 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CNTN2Q02246 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CNTN2Q02246 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CNTN2Q02246 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CNTN2Q02246 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CNTN2Q02246 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNTN2Q02246 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNTN2Q02246 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNTN2Q02246 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNTN2Q02246 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNTN2Q02246 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNTN2Q02246 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNTN2Q02246 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNTN2Q02246 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNTN2Q02246 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNTN2Q02246 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNTN2Q02246 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNTN2Q02246 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CNTN2Q02246 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CNTN2Q02246 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNTN2Q02246 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNTN2Q02246 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNTN2Q02246 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNTN2Q02246 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNTN2Q02246 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNTN2Q02246 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNTN2Q02246 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNTN2Q02246 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNTN2Q02246 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNTN2Q02246 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNTN2Q02246 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNTN2Q02246 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNTN2Q02246 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNTN2Q02246 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNTN2Q02246 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNTN2Q02246 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNTN2Q02246 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CNTN2Q02246 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CNTN2Q02246 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CNTN2Q02246 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CNTN2Q02246 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNTN2Q02246 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CNTN2Q02246 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNTN2Q02246 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNTN2Q02246 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNTN2Q02246 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNTN2Q02246 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CNTN2Q02246 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNTN2Q02246 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNTN2Q02246 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNTN2Q02246 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNTN2Q02246 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNTN2Q02246 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CNTN2Q02246 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNTN2Q02246 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNTN2Q02246 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNTN2Q02246 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNTN2Q02246 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CNTN2Q02246 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CNTN2Q02246 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CNTN2Q02246 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNTN2Q02246 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNTN2Q02246 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNTN2Q02246 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNTN2Q02246 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNTN2Q02246 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNTN2Q02246 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNTN2Q02246 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNTN2Q02246 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNTN2Q02246 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNTN2Q02246 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNTN2Q02246 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNTN2Q02246 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNTN2Q02246 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNTN2Q02246 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNTN2Q02246 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNTN2Q02246 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNTN2Q02246 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNTN2Q02246 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNTN2Q02246 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNTN2Q02246 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNTN2Q02246 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNTN2Q02246 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNTN2Q02246 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNTN2Q02246 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNTN2Q02246 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNTN2Q02246 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNTN2Q02246 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNTN2Q02246 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CNTN2Q02246 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CNTN2Q02246 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms