Protein–RNA interactions for Protein: P63261

ACTG1, Actin, cytoplasmic 2, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG1P63261 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTG1P63261 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTG1P63261 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTG1P63261 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTG1P63261 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTG1P63261 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTG1P63261 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTG1P63261 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTG1P63261 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTG1P63261 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTG1P63261 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTG1P63261 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTG1P63261 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTG1P63261 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTG1P63261 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTG1P63261 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTG1P63261 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTG1P63261 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTG1P63261 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTG1P63261 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTG1P63261 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTG1P63261 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTG1P63261 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTG1P63261 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTG1P63261 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTG1P63261 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTG1P63261 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTG1P63261 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTG1P63261 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTG1P63261 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTG1P63261 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTG1P63261 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTG1P63261 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTG1P63261 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTG1P63261 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTG1P63261 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTG1P63261 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTG1P63261 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTG1P63261 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTG1P63261 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTG1P63261 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ACTG1P63261 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTG1P63261 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTG1P63261 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTG1P63261 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTG1P63261 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTG1P63261 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTG1P63261 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTG1P63261 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTG1P63261 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTG1P63261 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTG1P63261 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTG1P63261 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTG1P63261 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTG1P63261 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTG1P63261 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTG1P63261 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTG1P63261 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTG1P63261 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTG1P63261 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTG1P63261 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTG1P63261 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTG1P63261 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTG1P63261 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTG1P63261 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTG1P63261 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTG1P63261 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTG1P63261 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTG1P63261 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTG1P63261 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTG1P63261 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTG1P63261 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTG1P63261 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACTG1P63261 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTG1P63261 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTG1P63261 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTG1P63261 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTG1P63261 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTG1P63261 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTG1P63261 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTG1P63261 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTG1P63261 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTG1P63261 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTG1P63261 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTG1P63261 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTG1P63261 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTG1P63261 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTG1P63261 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTG1P63261 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTG1P63261 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTG1P63261 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTG1P63261 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTG1P63261 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTG1P63261 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTG1P63261 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTG1P63261 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTG1P63261 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTG1P63261 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTG1P63261 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTG1P63261 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms