Protein–RNA interactions for Protein: P56282

POLE2, DNA polymerase epsilon subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE2P56282 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLE2P56282 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLE2P56282 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLE2P56282 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
POLE2P56282 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLE2P56282 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
POLE2P56282 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLE2P56282 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLE2P56282 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLE2P56282 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLE2P56282 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLE2P56282 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLE2P56282 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLE2P56282 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLE2P56282 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLE2P56282 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLE2P56282 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLE2P56282 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLE2P56282 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLE2P56282 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLE2P56282 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLE2P56282 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
POLE2P56282 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLE2P56282 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLE2P56282 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
POLE2P56282 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLE2P56282 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLE2P56282 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLE2P56282 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLE2P56282 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLE2P56282 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLE2P56282 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLE2P56282 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLE2P56282 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLE2P56282 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLE2P56282 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
POLE2P56282 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLE2P56282 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLE2P56282 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLE2P56282 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLE2P56282 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLE2P56282 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
POLE2P56282 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLE2P56282 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLE2P56282 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
POLE2P56282 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLE2P56282 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLE2P56282 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLE2P56282 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
POLE2P56282 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
POLE2P56282 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
POLE2P56282 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
POLE2P56282 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
POLE2P56282 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLE2P56282 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLE2P56282 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLE2P56282 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLE2P56282 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLE2P56282 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLE2P56282 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLE2P56282 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLE2P56282 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
POLE2P56282 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLE2P56282 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLE2P56282 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLE2P56282 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLE2P56282 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLE2P56282 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLE2P56282 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLE2P56282 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLE2P56282 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLE2P56282 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLE2P56282 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLE2P56282 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLE2P56282 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLE2P56282 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLE2P56282 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLE2P56282 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLE2P56282 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLE2P56282 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLE2P56282 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
POLE2P56282 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLE2P56282 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLE2P56282 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLE2P56282 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLE2P56282 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLE2P56282 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLE2P56282 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLE2P56282 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLE2P56282 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLE2P56282 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
POLE2P56282 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLE2P56282 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLE2P56282 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLE2P56282 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLE2P56282 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
POLE2P56282 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLE2P56282 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLE2P56282 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLE2P56282 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms