Protein–RNA interactions for Protein: P54845

NRL, Neural retina-specific leucine zipper protein, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRLP54845 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NRLP54845 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NRLP54845 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NRLP54845 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NRLP54845 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NRLP54845 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NRLP54845 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NRLP54845 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NRLP54845 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NRLP54845 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NRLP54845 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NRLP54845 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NRLP54845 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NRLP54845 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NRLP54845 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NRLP54845 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NRLP54845 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NRLP54845 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NRLP54845 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NRLP54845 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NRLP54845 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NRLP54845 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NRLP54845 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NRLP54845 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NRLP54845 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NRLP54845 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NRLP54845 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NRLP54845 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NRLP54845 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NRLP54845 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NRLP54845 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NRLP54845 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NRLP54845 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NRLP54845 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NRLP54845 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NRLP54845 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NRLP54845 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NRLP54845 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NRLP54845 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NRLP54845 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NRLP54845 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NRLP54845 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NRLP54845 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NRLP54845 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NRLP54845 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NRLP54845 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NRLP54845 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NRLP54845 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NRLP54845 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NRLP54845 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NRLP54845 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NRLP54845 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NRLP54845 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NRLP54845 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NRLP54845 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NRLP54845 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NRLP54845 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NRLP54845 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NRLP54845 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NRLP54845 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NRLP54845 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NRLP54845 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NRLP54845 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NRLP54845 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NRLP54845 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NRLP54845 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NRLP54845 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NRLP54845 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NRLP54845 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NRLP54845 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NRLP54845 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NRLP54845 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NRLP54845 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NRLP54845 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NRLP54845 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NRLP54845 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NRLP54845 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NRLP54845 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NRLP54845 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NRLP54845 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NRLP54845 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NRLP54845 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NRLP54845 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NRLP54845 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NRLP54845 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NRLP54845 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NRLP54845 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NRLP54845 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NRLP54845 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NRLP54845 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NRLP54845 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NRLP54845 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NRLP54845 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NRLP54845 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NRLP54845 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NRLP54845 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NRLP54845 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NRLP54845 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NRLP54845 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NRLP54845 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms