Protein–RNA interactions for Protein: P53040

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, yeastyeast

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TAF6P53040 YNL108CYNL108C 813 nt5.53□□□□□ -1.52
TAF6P53040 SET5YHR207C 1581 nt5.53□□□□□ -1.52
TAF6P53040 SRP101YDR292C 1866 nt5.53□□□□□ -1.52
TAF6P53040 VHS1YDR247W 1386 nt5.53□□□□□ -1.52
TAF6P53040 SSY5YJL156C 2100 nt5.53□□□□□ -1.52
TAF6P53040 YIR020W-AYIR020W-A 243 nt5.52□□□□□ -1.53
TAF6P53040 DPH2YKL191W 1605 nt5.52□□□□□ -1.53
TAF6P53040 HRP1YOL123W 1605 nt5.52□□□□□ -1.53
TAF6P53040 HAP1YLR256W 4509 nt5.51□□□□□ -1.53
TAF6P53040 YGL072CYGL072C 360 nt5.51□□□□□ -1.53
TAF6P53040 MND2YIR025W 1107 nt5.51□□□□□ -1.53
TAF6P53040 MTW1YAL034W-A 870 nt5.51□□□□□ -1.53
TAF6P53040 PGA3YML125C 939 nt5.51□□□□□ -1.53
TAF6P53040 AVO1YOL078W 3531 nt5.51□□□□□ -1.53
TAF6P53040 DUR1,2YBR208C 5508 nt5.5□□□□□ -1.53
TAF6P53040 ATE1YGL017W 1512 nt5.5□□□□□ -1.53
TAF6P53040 AAP1YHR047C 2571 nt5.5□□□□□ -1.53
TAF6P53040 YDR396WYDR396W 501 nt5.5□□□□□ -1.53
TAF6P53040 TEL2YGR099W 2067 nt5.5□□□□□ -1.53
TAF6P53040 DDC1YPL194W 1839 nt5.5□□□□□ -1.53
TAF6P53040 UBX2YML013W 1755 nt5.5□□□□□ -1.53
TAF6P53040 LYS21YDL131W 1323 nt5.49□□□□□ -1.53
TAF6P53040 SEC18YBR080C 2277 nt5.49□□□□□ -1.53
TAF6P53040 YNR048WYNR048W 1182 nt5.49□□□□□ -1.53
TAF6P53040 ENV7YPL236C 1095 nt5.49□□□□□ -1.53
TAF6P53040 YPR195CYPR195C 330 nt5.49□□□□□ -1.53
TAF6P53040 ALT1YLR089C 1779 nt5.49□□□□□ -1.53
TAF6P53040 VMS1YDR049W 1899 nt5.49□□□□□ -1.53
TAF6P53040 GUP2YPL189W 1830 nt5.48□□□□□ -1.53
TAF6P53040 DED81YHR019C 1665 nt5.48□□□□□ -1.53
TAF6P53040 SHM1YBR263W 1473 nt5.48□□□□□ -1.53
TAF6P53040 RML2YEL050C 1182 nt5.48□□□□□ -1.53
TAF6P53040 MRF1YGL143C 1242 nt5.48□□□□□ -1.53
TAF6P53040 YJL171CYJL171C 1191 nt5.48□□□□□ -1.53
TAF6P53040 REC114YMR133W 1287 nt5.48□□□□□ -1.53
TAF6P53040 SHE10YGL228W 1734 nt5.48□□□□□ -1.53
TAF6P53040 COX17YLL009C 210 nt5.47□□□□□ -1.53
TAF6P53040 UBC4YBR082C 447 nt5.47□□□□□ -1.53
TAF6P53040 DRS1YLL008W 2259 nt5.47□□□□□ -1.53
TAF6P53040 SYG1YIL047C 2709 nt5.47□□□□□ -1.53
TAF6P53040 SIT1YEL065W 1887 nt5.47□□□□□ -1.53
TAF6P53040 ATG7YHR171W 1893 nt5.47□□□□□ -1.53
TAF6P53040 DAK1YML070W 1755 nt5.47□□□□□ -1.53
TAF6P53040 FAT3YKL187C 2253 nt5.46□□□□□ -1.53
TAF6P53040 YCR047W-AYCR047W-A 207 nt5.46□□□□□ -1.54
TAF6P53040 MDH3YDL078C 1032 nt5.46□□□□□ -1.54
TAF6P53040 DFM1YDR411C 1026 nt5.46□□□□□ -1.54
TAF6P53040 MED6YHR058C 888 nt5.46□□□□□ -1.54
TAF6P53040 PAN6YIL145C 930 nt5.46□□□□□ -1.54
TAF6P53040 LEM3YNL323W 1245 nt5.46□□□□□ -1.54
TAF6P53040 RPO26YPR187W 468 nt5.46□□□□□ -1.54
TAF6P53040 STE50YCL032W 1041 nt5.46□□□□□ -1.54
TAF6P53040 OXP1YKL215C 3861 nt5.46□□□□□ -1.54
TAF6P53040 HES1YOR237W 1305 nt5.46□□□□□ -1.54
TAF6P53040 UTP9YHR196W 1728 nt5.45□□□□□ -1.54
TAF6P53040 BIT2YBR270C 1638 nt5.45□□□□□ -1.54
TAF6P53040 QDR1YIL120W 1692 nt5.45□□□□□ -1.54
TAF6P53040 SIT4YDL047W 936 nt5.45□□□□□ -1.54
TAF6P53040 ECM19YLR390W 339 nt5.45□□□□□ -1.54
TAF6P53040 ATG17YLR423C 1254 nt5.45□□□□□ -1.54
TAF6P53040 TRP1YDR007W 675 nt5.44□□□□□ -1.54
TAF6P53040 PRS2YER099C 957 nt5.44□□□□□ -1.54
TAF6P53040 YMR155WYMR155W 1644 nt5.44□□□□□ -1.54
TAF6P53040 GEP3YOR205C 1671 nt5.43□□□□□ -1.54
TAF6P53040 IES1YFL013C 2079 nt5.43□□□□□ -1.54
TAF6P53040 QRI1YDL103C 1434 nt5.43□□□□□ -1.54
TAF6P53040 RPS19BYNL302C 435 nt5.43□□□□□ -1.54
TAF6P53040 GPM3YOL056W 912 nt5.43□□□□□ -1.54
TAF6P53040 BPL1YDL141W 2073 nt5.43□□□□□ -1.54
TAF6P53040 PUF3YLL013C 2640 nt5.42□□□□□ -1.54
TAF6P53040 YDR154CYDR154C 351 nt5.42□□□□□ -1.54
TAF6P53040 NCS6YGL211W 1080 nt5.42□□□□□ -1.54
TAF6P53040 SPO7YAL009W 780 nt5.42□□□□□ -1.54
TAF6P53040 MPM1YJL066C 759 nt5.42□□□□□ -1.54
TAF6P53040 AVO2YMR068W 1281 nt5.42□□□□□ -1.54
TAF6P53040 PIN2YOR104W 849 nt5.42□□□□□ -1.54
TAF6P53040 FRE3YOR381W 2136 nt5.42□□□□□ -1.54
TAF6P53040 RPT1YKL145W 1404 nt5.41□□□□□ -1.54
TAF6P53040 RRN3YKL125W 1884 nt5.41□□□□□ -1.54
TAF6P53040 KIP2YPL155C 2121 nt5.41□□□□□ -1.54
TAF6P53040 YDL121CYDL121C 450 nt5.41□□□□□ -1.54
TAF6P53040 APN1YKL114C 1104 nt5.41□□□□□ -1.54
TAF6P53040 UIP4YPL186C 915 nt5.41□□□□□ -1.54
TAF6P53040 NPL6YMR091C 1308 nt5.41□□□□□ -1.54
TAF6P53040 BNA5YLR231C 1362 nt5.41□□□□□ -1.54
TAF6P53040 FLC3YGL139W 2409 nt5.4□□□□□ -1.54
TAF6P53040 YFL034WYFL034W 3222 nt5.4□□□□□ -1.54
TAF6P53040 SLT2YHR030C 1455 nt5.4□□□□□ -1.54
TAF6P53040 YJL107CYJL107C 1164 nt5.4□□□□□ -1.54
TAF6P53040 YLR126CYLR126C 756 nt5.4□□□□□ -1.54
TAF6P53040 RPA49YNL248C 1248 nt5.4□□□□□ -1.54
TAF6P53040 YJL211CYJL211C 444 nt5.39□□□□□ -1.55
TAF6P53040 SEC17YBL050W 879 nt5.39□□□□□ -1.55
TAF6P53040 YOR024WYOR024W 324 nt5.39□□□□□ -1.55
TAF6P53040 SCO1YBR037C 888 nt5.39□□□□□ -1.55
TAF6P53040 YHR045WYHR045W 1683 nt5.39□□□□□ -1.55
TAF6P53040 DBF4YDR052C 2115 nt5.38□□□□□ -1.55
TAF6P53040 YDL144CYDL144C 1071 nt5.38□□□□□ -1.55
TAF6P53040 COX26YDR119W-A 201 nt5.38□□□□□ -1.55
TAF6P53040 tN(GUU)CtN(GUU)C 74 nt5.38□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 18.6 ms