Protein–RNA interactions for Protein: P52954

LBX1, Transcription factor LBX1, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBX1P52954 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LBX1P52954 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LBX1P52954 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LBX1P52954 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LBX1P52954 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LBX1P52954 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LBX1P52954 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LBX1P52954 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LBX1P52954 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LBX1P52954 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LBX1P52954 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LBX1P52954 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LBX1P52954 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LBX1P52954 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LBX1P52954 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
LBX1P52954 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LBX1P52954 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LBX1P52954 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LBX1P52954 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LBX1P52954 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LBX1P52954 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
LBX1P52954 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LBX1P52954 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LBX1P52954 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
LBX1P52954 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
LBX1P52954 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
LBX1P52954 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
LBX1P52954 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
LBX1P52954 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
LBX1P52954 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LBX1P52954 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LBX1P52954 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LBX1P52954 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LBX1P52954 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LBX1P52954 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LBX1P52954 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LBX1P52954 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LBX1P52954 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
LBX1P52954 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LBX1P52954 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LBX1P52954 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LBX1P52954 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LBX1P52954 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LBX1P52954 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LBX1P52954 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LBX1P52954 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LBX1P52954 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LBX1P52954 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LBX1P52954 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LBX1P52954 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LBX1P52954 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LBX1P52954 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LBX1P52954 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LBX1P52954 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LBX1P52954 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
LBX1P52954 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LBX1P52954 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LBX1P52954 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LBX1P52954 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LBX1P52954 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LBX1P52954 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
LBX1P52954 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LBX1P52954 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LBX1P52954 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
LBX1P52954 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LBX1P52954 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LBX1P52954 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LBX1P52954 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LBX1P52954 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LBX1P52954 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LBX1P52954 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LBX1P52954 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LBX1P52954 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
LBX1P52954 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
LBX1P52954 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
LBX1P52954 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LBX1P52954 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
LBX1P52954 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LBX1P52954 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
LBX1P52954 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LBX1P52954 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LBX1P52954 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LBX1P52954 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LBX1P52954 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LBX1P52954 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LBX1P52954 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LBX1P52954 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LBX1P52954 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LBX1P52954 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LBX1P52954 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LBX1P52954 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LBX1P52954 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LBX1P52954 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LBX1P52954 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LBX1P52954 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LBX1P52954 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LBX1P52954 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LBX1P52954 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LBX1P52954 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LBX1P52954 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms