Protein–RNA interactions for Protein: P48382

RFX5, DNA-binding protein RFX5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX5P48382 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RFX5P48382 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RFX5P48382 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RFX5P48382 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RFX5P48382 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RFX5P48382 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RFX5P48382 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
RFX5P48382 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RFX5P48382 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RFX5P48382 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RFX5P48382 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RFX5P48382 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RFX5P48382 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RFX5P48382 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RFX5P48382 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RFX5P48382 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RFX5P48382 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RFX5P48382 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RFX5P48382 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RFX5P48382 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RFX5P48382 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RFX5P48382 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
RFX5P48382 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
RFX5P48382 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RFX5P48382 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RFX5P48382 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RFX5P48382 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RFX5P48382 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RFX5P48382 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RFX5P48382 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RFX5P48382 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RFX5P48382 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RFX5P48382 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RFX5P48382 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RFX5P48382 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RFX5P48382 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RFX5P48382 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RFX5P48382 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RFX5P48382 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
RFX5P48382 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RFX5P48382 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RFX5P48382 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RFX5P48382 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RFX5P48382 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RFX5P48382 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RFX5P48382 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RFX5P48382 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RFX5P48382 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RFX5P48382 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RFX5P48382 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RFX5P48382 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
RFX5P48382 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RFX5P48382 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RFX5P48382 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RFX5P48382 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RFX5P48382 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RFX5P48382 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RFX5P48382 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RFX5P48382 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RFX5P48382 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RFX5P48382 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RFX5P48382 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RFX5P48382 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RFX5P48382 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RFX5P48382 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RFX5P48382 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RFX5P48382 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
RFX5P48382 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RFX5P48382 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RFX5P48382 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RFX5P48382 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RFX5P48382 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RFX5P48382 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RFX5P48382 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RFX5P48382 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RFX5P48382 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RFX5P48382 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RFX5P48382 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RFX5P48382 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RFX5P48382 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
RFX5P48382 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
RFX5P48382 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RFX5P48382 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RFX5P48382 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RFX5P48382 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RFX5P48382 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
RFX5P48382 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RFX5P48382 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
RFX5P48382 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC29■■■□□ 2.23
RFX5P48382 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC29■■■□□ 2.23
RFX5P48382 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
RFX5P48382 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RFX5P48382 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
RFX5P48382 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
RFX5P48382 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
RFX5P48382 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RFX5P48382 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RFX5P48382 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RFX5P48382 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RFX5P48382 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms