Protein–RNA interactions for Protein: P46094

XCR1, Chemokine XC receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCR1P46094 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
XCR1P46094 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XCR1P46094 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XCR1P46094 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XCR1P46094 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XCR1P46094 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XCR1P46094 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XCR1P46094 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XCR1P46094 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
XCR1P46094 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
XCR1P46094 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
XCR1P46094 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
XCR1P46094 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
XCR1P46094 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
XCR1P46094 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
XCR1P46094 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XCR1P46094 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XCR1P46094 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XCR1P46094 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XCR1P46094 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
XCR1P46094 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
XCR1P46094 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
XCR1P46094 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
XCR1P46094 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
XCR1P46094 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XCR1P46094 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XCR1P46094 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XCR1P46094 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XCR1P46094 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XCR1P46094 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
XCR1P46094 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XCR1P46094 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XCR1P46094 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XCR1P46094 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XCR1P46094 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XCR1P46094 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XCR1P46094 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
XCR1P46094 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
XCR1P46094 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
XCR1P46094 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
XCR1P46094 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
XCR1P46094 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
XCR1P46094 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
XCR1P46094 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
XCR1P46094 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XCR1P46094 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
XCR1P46094 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XCR1P46094 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
XCR1P46094 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
XCR1P46094 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
XCR1P46094 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
XCR1P46094 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XCR1P46094 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XCR1P46094 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
XCR1P46094 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
XCR1P46094 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
XCR1P46094 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
XCR1P46094 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
XCR1P46094 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XCR1P46094 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
XCR1P46094 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
XCR1P46094 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
XCR1P46094 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
XCR1P46094 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
XCR1P46094 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
XCR1P46094 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
XCR1P46094 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
XCR1P46094 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
XCR1P46094 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
XCR1P46094 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
XCR1P46094 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
XCR1P46094 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
XCR1P46094 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
XCR1P46094 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
XCR1P46094 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
XCR1P46094 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
XCR1P46094 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
XCR1P46094 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
XCR1P46094 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
XCR1P46094 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
XCR1P46094 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
XCR1P46094 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
XCR1P46094 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
XCR1P46094 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
XCR1P46094 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
XCR1P46094 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
XCR1P46094 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
XCR1P46094 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
XCR1P46094 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
XCR1P46094 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
XCR1P46094 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
XCR1P46094 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XCR1P46094 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
XCR1P46094 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XCR1P46094 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
XCR1P46094 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XCR1P46094 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XCR1P46094 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XCR1P46094 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XCR1P46094 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms