Protein–RNA interactions for Protein: P46013

MKI67, Proliferation marker protein Ki-67, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKI67P46013 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MKI67P46013 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
MKI67P46013 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MKI67P46013 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MKI67P46013 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MKI67P46013 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MKI67P46013 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
MKI67P46013 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MKI67P46013 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MKI67P46013 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MKI67P46013 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MKI67P46013 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MKI67P46013 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MKI67P46013 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MKI67P46013 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MKI67P46013 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MKI67P46013 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MKI67P46013 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MKI67P46013 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MKI67P46013 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MKI67P46013 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MKI67P46013 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MKI67P46013 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MKI67P46013 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MKI67P46013 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MKI67P46013 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
MKI67P46013 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.83
MKI67P46013 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
MKI67P46013 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MKI67P46013 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
MKI67P46013 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MKI67P46013 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MKI67P46013 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MKI67P46013 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MKI67P46013 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MKI67P46013 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MKI67P46013 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MKI67P46013 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
MKI67P46013 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MKI67P46013 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MKI67P46013 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MKI67P46013 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MKI67P46013 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MKI67P46013 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
MKI67P46013 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MKI67P46013 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MKI67P46013 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MKI67P46013 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MKI67P46013 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
MKI67P46013 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MKI67P46013 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
MKI67P46013 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
MKI67P46013 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MKI67P46013 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MKI67P46013 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MKI67P46013 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MKI67P46013 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MKI67P46013 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MKI67P46013 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MKI67P46013 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MKI67P46013 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MKI67P46013 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MKI67P46013 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
MKI67P46013 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
MKI67P46013 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MKI67P46013 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
MKI67P46013 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
MKI67P46013 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
MKI67P46013 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
MKI67P46013 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
MKI67P46013 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
MKI67P46013 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MKI67P46013 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MKI67P46013 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MKI67P46013 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MKI67P46013 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MKI67P46013 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MKI67P46013 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MKI67P46013 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MKI67P46013 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MKI67P46013 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MKI67P46013 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MKI67P46013 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MKI67P46013 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MKI67P46013 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MKI67P46013 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MKI67P46013 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
MKI67P46013 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MKI67P46013 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MKI67P46013 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MKI67P46013 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MKI67P46013 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MKI67P46013 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MKI67P46013 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MKI67P46013 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MKI67P46013 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MKI67P46013 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MKI67P46013 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MKI67P46013 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MKI67P46013 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms