Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHRNA3P32297 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHRNA3P32297 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHRNA3P32297 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHRNA3P32297 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHRNA3P32297 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHRNA3P32297 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHRNA3P32297 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHRNA3P32297 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHRNA3P32297 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CHRNA3P32297 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHRNA3P32297 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHRNA3P32297 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRNA3P32297 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRNA3P32297 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRNA3P32297 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRNA3P32297 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRNA3P32297 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRNA3P32297 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRNA3P32297 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRNA3P32297 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRNA3P32297 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRNA3P32297 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRNA3P32297 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRNA3P32297 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRNA3P32297 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHRNA3P32297 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHRNA3P32297 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHRNA3P32297 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHRNA3P32297 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHRNA3P32297 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHRNA3P32297 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHRNA3P32297 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHRNA3P32297 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHRNA3P32297 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHRNA3P32297 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHRNA3P32297 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHRNA3P32297 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHRNA3P32297 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHRNA3P32297 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHRNA3P32297 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHRNA3P32297 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHRNA3P32297 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHRNA3P32297 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHRNA3P32297 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHRNA3P32297 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHRNA3P32297 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHRNA3P32297 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHRNA3P32297 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHRNA3P32297 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHRNA3P32297 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHRNA3P32297 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHRNA3P32297 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHRNA3P32297 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHRNA3P32297 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHRNA3P32297 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHRNA3P32297 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHRNA3P32297 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHRNA3P32297 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHRNA3P32297 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHRNA3P32297 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHRNA3P32297 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHRNA3P32297 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHRNA3P32297 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHRNA3P32297 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHRNA3P32297 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHRNA3P32297 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHRNA3P32297 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CHRNA3P32297 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHRNA3P32297 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHRNA3P32297 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHRNA3P32297 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHRNA3P32297 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHRNA3P32297 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHRNA3P32297 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHRNA3P32297 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHRNA3P32297 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHRNA3P32297 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CHRNA3P32297 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHRNA3P32297 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHRNA3P32297 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHRNA3P32297 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHRNA3P32297 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHRNA3P32297 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CHRNA3P32297 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHRNA3P32297 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHRNA3P32297 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHRNA3P32297 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHRNA3P32297 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHRNA3P32297 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CHRNA3P32297 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHRNA3P32297 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHRNA3P32297 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHRNA3P32297 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHRNA3P32297 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHRNA3P32297 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHRNA3P32297 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHRNA3P32297 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHRNA3P32297 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHRNA3P32297 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms