Protein–RNA interactions for Protein: P29353

SHC1, SHC-transforming protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC1P29353 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SHC1P29353 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SHC1P29353 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SHC1P29353 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SHC1P29353 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SHC1P29353 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SHC1P29353 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHC1P29353 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHC1P29353 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHC1P29353 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHC1P29353 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHC1P29353 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHC1P29353 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHC1P29353 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHC1P29353 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHC1P29353 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHC1P29353 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHC1P29353 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHC1P29353 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHC1P29353 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHC1P29353 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHC1P29353 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHC1P29353 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHC1P29353 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHC1P29353 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHC1P29353 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHC1P29353 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHC1P29353 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHC1P29353 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHC1P29353 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SHC1P29353 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SHC1P29353 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SHC1P29353 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SHC1P29353 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SHC1P29353 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SHC1P29353 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SHC1P29353 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SHC1P29353 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SHC1P29353 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHC1P29353 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHC1P29353 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHC1P29353 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHC1P29353 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHC1P29353 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHC1P29353 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHC1P29353 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHC1P29353 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHC1P29353 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHC1P29353 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHC1P29353 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHC1P29353 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHC1P29353 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHC1P29353 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHC1P29353 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHC1P29353 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SHC1P29353 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHC1P29353 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHC1P29353 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHC1P29353 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHC1P29353 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHC1P29353 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SHC1P29353 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHC1P29353 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHC1P29353 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SHC1P29353 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHC1P29353 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SHC1P29353 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SHC1P29353 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SHC1P29353 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SHC1P29353 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SHC1P29353 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHC1P29353 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHC1P29353 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHC1P29353 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHC1P29353 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHC1P29353 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHC1P29353 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHC1P29353 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHC1P29353 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHC1P29353 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHC1P29353 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHC1P29353 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHC1P29353 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SHC1P29353 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SHC1P29353 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SHC1P29353 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SHC1P29353 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SHC1P29353 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SHC1P29353 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SHC1P29353 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SHC1P29353 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SHC1P29353 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SHC1P29353 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SHC1P29353 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SHC1P29353 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SHC1P29353 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SHC1P29353 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SHC1P29353 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SHC1P29353 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SHC1P29353 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms