Protein–RNA interactions for Protein: P21941

MATN1, Cartilage matrix protein, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATN1P21941 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MATN1P21941 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MATN1P21941 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MATN1P21941 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MATN1P21941 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MATN1P21941 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MATN1P21941 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MATN1P21941 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MATN1P21941 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MATN1P21941 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MATN1P21941 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MATN1P21941 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MATN1P21941 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MATN1P21941 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MATN1P21941 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MATN1P21941 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MATN1P21941 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MATN1P21941 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MATN1P21941 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MATN1P21941 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MATN1P21941 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MATN1P21941 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MATN1P21941 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MATN1P21941 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MATN1P21941 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MATN1P21941 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MATN1P21941 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MATN1P21941 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MATN1P21941 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MATN1P21941 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MATN1P21941 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MATN1P21941 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MATN1P21941 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MATN1P21941 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MATN1P21941 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MATN1P21941 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MATN1P21941 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MATN1P21941 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MATN1P21941 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MATN1P21941 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MATN1P21941 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MATN1P21941 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MATN1P21941 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MATN1P21941 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MATN1P21941 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MATN1P21941 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MATN1P21941 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MATN1P21941 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MATN1P21941 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MATN1P21941 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MATN1P21941 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MATN1P21941 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MATN1P21941 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MATN1P21941 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MATN1P21941 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MATN1P21941 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MATN1P21941 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MATN1P21941 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MATN1P21941 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MATN1P21941 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MATN1P21941 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MATN1P21941 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MATN1P21941 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MATN1P21941 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MATN1P21941 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MATN1P21941 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MATN1P21941 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MATN1P21941 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MATN1P21941 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MATN1P21941 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MATN1P21941 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MATN1P21941 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MATN1P21941 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MATN1P21941 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MATN1P21941 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MATN1P21941 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MATN1P21941 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MATN1P21941 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MATN1P21941 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MATN1P21941 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MATN1P21941 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MATN1P21941 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MATN1P21941 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MATN1P21941 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MATN1P21941 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MATN1P21941 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MATN1P21941 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MATN1P21941 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MATN1P21941 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MATN1P21941 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MATN1P21941 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MATN1P21941 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MATN1P21941 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MATN1P21941 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MATN1P21941 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MATN1P21941 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MATN1P21941 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MATN1P21941 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MATN1P21941 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MATN1P21941 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms