Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DSPP15924 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DSPP15924 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DSPP15924 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DSPP15924 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DSPP15924 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DSPP15924 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DSPP15924 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DSPP15924 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DSPP15924 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DSPP15924 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DSPP15924 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DSPP15924 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DSPP15924 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DSPP15924 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DSPP15924 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DSPP15924 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
DSPP15924 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DSPP15924 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
DSPP15924 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DSPP15924 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DSPP15924 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DSPP15924 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DSPP15924 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DSPP15924 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DSPP15924 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DSPP15924 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DSPP15924 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DSPP15924 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DSPP15924 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DSPP15924 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DSPP15924 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DSPP15924 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DSPP15924 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DSPP15924 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DSPP15924 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DSPP15924 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DSPP15924 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DSPP15924 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DSPP15924 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DSPP15924 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DSPP15924 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DSPP15924 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DSPP15924 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DSPP15924 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DSPP15924 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DSPP15924 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DSPP15924 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DSPP15924 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DSPP15924 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DSPP15924 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DSPP15924 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DSPP15924 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DSPP15924 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DSPP15924 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSPP15924 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSPP15924 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSPP15924 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSPP15924 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSPP15924 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSPP15924 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSPP15924 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DSPP15924 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DSPP15924 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DSPP15924 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DSPP15924 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DSPP15924 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DSPP15924 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DSPP15924 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DSPP15924 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DSPP15924 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DSPP15924 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DSPP15924 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
DSPP15924 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DSPP15924 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DSPP15924 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DSPP15924 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DSPP15924 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DSPP15924 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DSPP15924 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DSPP15924 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DSPP15924 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DSPP15924 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
DSPP15924 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DSPP15924 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DSPP15924 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DSPP15924 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DSPP15924 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DSPP15924 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DSPP15924 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DSPP15924 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DSPP15924 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DSPP15924 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DSPP15924 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DSPP15924 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DSPP15924 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DSPP15924 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DSPP15924 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DSPP15924 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DSPP15924 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms