Protein–RNA interactions for Protein: P13501

CCL5, C-C motif chemokine 5, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL5P13501 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCL5P13501 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCL5P13501 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCL5P13501 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCL5P13501 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCL5P13501 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCL5P13501 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCL5P13501 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCL5P13501 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CCL5P13501 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CCL5P13501 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCL5P13501 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCL5P13501 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCL5P13501 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCL5P13501 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCL5P13501 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCL5P13501 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CCL5P13501 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCL5P13501 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCL5P13501 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCL5P13501 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCL5P13501 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCL5P13501 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CCL5P13501 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCL5P13501 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCL5P13501 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCL5P13501 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCL5P13501 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CCL5P13501 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CCL5P13501 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CCL5P13501 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CCL5P13501 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCL5P13501 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCL5P13501 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCL5P13501 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCL5P13501 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCL5P13501 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCL5P13501 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCL5P13501 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCL5P13501 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCL5P13501 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCL5P13501 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCL5P13501 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCL5P13501 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCL5P13501 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCL5P13501 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCL5P13501 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCL5P13501 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CCL5P13501 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CCL5P13501 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCL5P13501 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCL5P13501 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCL5P13501 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCL5P13501 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCL5P13501 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCL5P13501 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCL5P13501 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCL5P13501 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCL5P13501 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCL5P13501 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCL5P13501 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCL5P13501 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCL5P13501 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCL5P13501 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCL5P13501 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCL5P13501 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCL5P13501 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CCL5P13501 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCL5P13501 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCL5P13501 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCL5P13501 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CCL5P13501 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCL5P13501 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCL5P13501 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCL5P13501 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCL5P13501 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCL5P13501 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCL5P13501 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCL5P13501 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCL5P13501 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CCL5P13501 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCL5P13501 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCL5P13501 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCL5P13501 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCL5P13501 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCL5P13501 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCL5P13501 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCL5P13501 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCL5P13501 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCL5P13501 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCL5P13501 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCL5P13501 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCL5P13501 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCL5P13501 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCL5P13501 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CCL5P13501 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCL5P13501 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCL5P13501 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCL5P13501 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCL5P13501 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms