Protein–RNA interactions for Protein: P12270

TPR, Nucleoprotein TPR, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRP12270 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TPRP12270 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPRP12270 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPRP12270 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TPRP12270 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPRP12270 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPRP12270 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPRP12270 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPRP12270 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPRP12270 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPRP12270 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPRP12270 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TPRP12270 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TPRP12270 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TPRP12270 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPRP12270 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPRP12270 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPRP12270 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPRP12270 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPRP12270 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPRP12270 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPRP12270 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPRP12270 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TPRP12270 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPRP12270 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TPRP12270 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TPRP12270 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPRP12270 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPRP12270 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPRP12270 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TPRP12270 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPRP12270 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TPRP12270 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPRP12270 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPRP12270 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPRP12270 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TPRP12270 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPRP12270 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPRP12270 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPRP12270 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPRP12270 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPRP12270 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPRP12270 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPRP12270 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPRP12270 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPRP12270 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPRP12270 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPRP12270 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPRP12270 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPRP12270 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPRP12270 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPRP12270 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPRP12270 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPRP12270 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPRP12270 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPRP12270 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPRP12270 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPRP12270 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPRP12270 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPRP12270 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPRP12270 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPRP12270 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPRP12270 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPRP12270 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPRP12270 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPRP12270 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPRP12270 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TPRP12270 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TPRP12270 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TPRP12270 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TPRP12270 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPRP12270 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPRP12270 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPRP12270 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPRP12270 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPRP12270 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPRP12270 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPRP12270 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPRP12270 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPRP12270 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPRP12270 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TPRP12270 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPRP12270 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPRP12270 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPRP12270 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPRP12270 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPRP12270 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPRP12270 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPRP12270 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPRP12270 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPRP12270 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPRP12270 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPRP12270 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPRP12270 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPRP12270 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPRP12270 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TPRP12270 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPRP12270 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPRP12270 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPRP12270 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms