Protein–RNA interactions for Protein: P0CG20

PRR35, Proline-rich protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR35P0CG20 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRR35P0CG20 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRR35P0CG20 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRR35P0CG20 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRR35P0CG20 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRR35P0CG20 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRR35P0CG20 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRR35P0CG20 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRR35P0CG20 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRR35P0CG20 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRR35P0CG20 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRR35P0CG20 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRR35P0CG20 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRR35P0CG20 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRR35P0CG20 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PRR35P0CG20 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRR35P0CG20 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRR35P0CG20 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRR35P0CG20 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRR35P0CG20 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRR35P0CG20 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRR35P0CG20 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRR35P0CG20 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRR35P0CG20 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRR35P0CG20 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRR35P0CG20 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRR35P0CG20 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRR35P0CG20 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRR35P0CG20 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRR35P0CG20 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRR35P0CG20 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRR35P0CG20 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRR35P0CG20 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRR35P0CG20 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRR35P0CG20 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PRR35P0CG20 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRR35P0CG20 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PRR35P0CG20 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRR35P0CG20 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRR35P0CG20 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRR35P0CG20 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRR35P0CG20 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRR35P0CG20 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRR35P0CG20 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRR35P0CG20 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRR35P0CG20 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRR35P0CG20 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRR35P0CG20 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRR35P0CG20 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRR35P0CG20 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRR35P0CG20 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRR35P0CG20 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRR35P0CG20 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRR35P0CG20 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRR35P0CG20 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRR35P0CG20 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRR35P0CG20 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRR35P0CG20 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRR35P0CG20 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRR35P0CG20 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRR35P0CG20 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRR35P0CG20 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRR35P0CG20 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRR35P0CG20 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRR35P0CG20 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRR35P0CG20 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRR35P0CG20 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRR35P0CG20 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRR35P0CG20 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRR35P0CG20 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRR35P0CG20 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRR35P0CG20 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRR35P0CG20 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRR35P0CG20 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRR35P0CG20 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRR35P0CG20 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRR35P0CG20 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRR35P0CG20 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRR35P0CG20 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRR35P0CG20 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRR35P0CG20 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PRR35P0CG20 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRR35P0CG20 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRR35P0CG20 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRR35P0CG20 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRR35P0CG20 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRR35P0CG20 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRR35P0CG20 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRR35P0CG20 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRR35P0CG20 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRR35P0CG20 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRR35P0CG20 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRR35P0CG20 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRR35P0CG20 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRR35P0CG20 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRR35P0CG20 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRR35P0CG20 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRR35P0CG20 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRR35P0CG20 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PRR35P0CG20 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms