Protein–RNA interactions for Protein: P0C860

MSL3P1, Putative male-specific lethal-3 protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSL3P1P0C860 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MSL3P1P0C860 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MSL3P1P0C860 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MSL3P1P0C860 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MSL3P1P0C860 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MSL3P1P0C860 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MSL3P1P0C860 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MSL3P1P0C860 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MSL3P1P0C860 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MSL3P1P0C860 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MSL3P1P0C860 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MSL3P1P0C860 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MSL3P1P0C860 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MSL3P1P0C860 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MSL3P1P0C860 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MSL3P1P0C860 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MSL3P1P0C860 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MSL3P1P0C860 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MSL3P1P0C860 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MSL3P1P0C860 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MSL3P1P0C860 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MSL3P1P0C860 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MSL3P1P0C860 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MSL3P1P0C860 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MSL3P1P0C860 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MSL3P1P0C860 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MSL3P1P0C860 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MSL3P1P0C860 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MSL3P1P0C860 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MSL3P1P0C860 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MSL3P1P0C860 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MSL3P1P0C860 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MSL3P1P0C860 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MSL3P1P0C860 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MSL3P1P0C860 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MSL3P1P0C860 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MSL3P1P0C860 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MSL3P1P0C860 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MSL3P1P0C860 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MSL3P1P0C860 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MSL3P1P0C860 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MSL3P1P0C860 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MSL3P1P0C860 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MSL3P1P0C860 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MSL3P1P0C860 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MSL3P1P0C860 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MSL3P1P0C860 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MSL3P1P0C860 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MSL3P1P0C860 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MSL3P1P0C860 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MSL3P1P0C860 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MSL3P1P0C860 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MSL3P1P0C860 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MSL3P1P0C860 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MSL3P1P0C860 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MSL3P1P0C860 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MSL3P1P0C860 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MSL3P1P0C860 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MSL3P1P0C860 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MSL3P1P0C860 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MSL3P1P0C860 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MSL3P1P0C860 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MSL3P1P0C860 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MSL3P1P0C860 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MSL3P1P0C860 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MSL3P1P0C860 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MSL3P1P0C860 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MSL3P1P0C860 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MSL3P1P0C860 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MSL3P1P0C860 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MSL3P1P0C860 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MSL3P1P0C860 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MSL3P1P0C860 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MSL3P1P0C860 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MSL3P1P0C860 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MSL3P1P0C860 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MSL3P1P0C860 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MSL3P1P0C860 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MSL3P1P0C860 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MSL3P1P0C860 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MSL3P1P0C860 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MSL3P1P0C860 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MSL3P1P0C860 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MSL3P1P0C860 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MSL3P1P0C860 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSL3P1P0C860 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSL3P1P0C860 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSL3P1P0C860 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSL3P1P0C860 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSL3P1P0C860 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSL3P1P0C860 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MSL3P1P0C860 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSL3P1P0C860 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSL3P1P0C860 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSL3P1P0C860 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSL3P1P0C860 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MSL3P1P0C860 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MSL3P1P0C860 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MSL3P1P0C860 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MSL3P1P0C860 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms