Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC175P0C221 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC175P0C221 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC175P0C221 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC175P0C221 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC175P0C221 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC175P0C221 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC175P0C221 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC175P0C221 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC175P0C221 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC175P0C221 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC175P0C221 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC175P0C221 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC175P0C221 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC175P0C221 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC175P0C221 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC175P0C221 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC175P0C221 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC175P0C221 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC175P0C221 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC175P0C221 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC175P0C221 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC175P0C221 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC175P0C221 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC175P0C221 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC175P0C221 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC175P0C221 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC175P0C221 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC175P0C221 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC175P0C221 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC175P0C221 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC175P0C221 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC175P0C221 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC175P0C221 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC175P0C221 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC175P0C221 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC175P0C221 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC175P0C221 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC175P0C221 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC175P0C221 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC175P0C221 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC175P0C221 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC175P0C221 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC175P0C221 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC175P0C221 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC175P0C221 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC175P0C221 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC175P0C221 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC175P0C221 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC175P0C221 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC175P0C221 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC175P0C221 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC175P0C221 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC175P0C221 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC175P0C221 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC175P0C221 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC175P0C221 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC175P0C221 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC175P0C221 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC175P0C221 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC175P0C221 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC175P0C221 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC175P0C221 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC175P0C221 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC175P0C221 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC175P0C221 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC175P0C221 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC175P0C221 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC175P0C221 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC175P0C221 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC175P0C221 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC175P0C221 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC175P0C221 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC175P0C221 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC175P0C221 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC175P0C221 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC175P0C221 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC175P0C221 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC175P0C221 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC175P0C221 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC175P0C221 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC175P0C221 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC175P0C221 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC175P0C221 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC175P0C221 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC175P0C221 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC175P0C221 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC175P0C221 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC175P0C221 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC175P0C221 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC175P0C221 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC175P0C221 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC175P0C221 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC175P0C221 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC175P0C221 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC175P0C221 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC175P0C221 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC175P0C221 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC175P0C221 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC175P0C221 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms