Protein–RNA interactions for Protein: P05423

POLR3D, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3DP05423 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
POLR3DP05423 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
POLR3DP05423 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
POLR3DP05423 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
POLR3DP05423 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
POLR3DP05423 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
POLR3DP05423 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
POLR3DP05423 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
POLR3DP05423 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
POLR3DP05423 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
POLR3DP05423 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
POLR3DP05423 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
POLR3DP05423 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
POLR3DP05423 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
POLR3DP05423 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
POLR3DP05423 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
POLR3DP05423 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
POLR3DP05423 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
POLR3DP05423 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
POLR3DP05423 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
POLR3DP05423 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
POLR3DP05423 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
POLR3DP05423 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
POLR3DP05423 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
POLR3DP05423 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
POLR3DP05423 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
POLR3DP05423 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
POLR3DP05423 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
POLR3DP05423 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
POLR3DP05423 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
POLR3DP05423 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
POLR3DP05423 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
POLR3DP05423 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
POLR3DP05423 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
POLR3DP05423 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
POLR3DP05423 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
POLR3DP05423 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
POLR3DP05423 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
POLR3DP05423 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
POLR3DP05423 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
POLR3DP05423 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
POLR3DP05423 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
POLR3DP05423 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
POLR3DP05423 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
POLR3DP05423 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
POLR3DP05423 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
POLR3DP05423 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
POLR3DP05423 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
POLR3DP05423 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
POLR3DP05423 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
POLR3DP05423 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
POLR3DP05423 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
POLR3DP05423 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
POLR3DP05423 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
POLR3DP05423 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
POLR3DP05423 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
POLR3DP05423 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
POLR3DP05423 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
POLR3DP05423 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
POLR3DP05423 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
POLR3DP05423 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
POLR3DP05423 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
POLR3DP05423 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
POLR3DP05423 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
POLR3DP05423 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
POLR3DP05423 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
POLR3DP05423 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
POLR3DP05423 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
POLR3DP05423 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
POLR3DP05423 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
POLR3DP05423 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
POLR3DP05423 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
POLR3DP05423 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
POLR3DP05423 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
POLR3DP05423 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
POLR3DP05423 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
POLR3DP05423 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
POLR3DP05423 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
POLR3DP05423 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
POLR3DP05423 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
POLR3DP05423 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
POLR3DP05423 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
POLR3DP05423 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
POLR3DP05423 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
POLR3DP05423 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
POLR3DP05423 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
POLR3DP05423 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
POLR3DP05423 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
POLR3DP05423 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
POLR3DP05423 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
POLR3DP05423 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
POLR3DP05423 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
POLR3DP05423 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
POLR3DP05423 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
POLR3DP05423 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
POLR3DP05423 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
POLR3DP05423 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
POLR3DP05423 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
POLR3DP05423 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
POLR3DP05423 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms