Protein–RNA interactions for Protein: P04278

SHBG, Sex hormone-binding globulin, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHBGP04278 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SHBGP04278 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SHBGP04278 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SHBGP04278 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SHBGP04278 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SHBGP04278 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SHBGP04278 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SHBGP04278 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SHBGP04278 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SHBGP04278 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SHBGP04278 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SHBGP04278 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SHBGP04278 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SHBGP04278 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SHBGP04278 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SHBGP04278 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SHBGP04278 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SHBGP04278 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SHBGP04278 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SHBGP04278 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SHBGP04278 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SHBGP04278 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SHBGP04278 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SHBGP04278 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SHBGP04278 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SHBGP04278 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SHBGP04278 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SHBGP04278 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SHBGP04278 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SHBGP04278 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SHBGP04278 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SHBGP04278 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SHBGP04278 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SHBGP04278 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SHBGP04278 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SHBGP04278 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SHBGP04278 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SHBGP04278 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SHBGP04278 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SHBGP04278 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SHBGP04278 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SHBGP04278 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SHBGP04278 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SHBGP04278 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SHBGP04278 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SHBGP04278 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SHBGP04278 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SHBGP04278 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SHBGP04278 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SHBGP04278 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SHBGP04278 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SHBGP04278 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SHBGP04278 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SHBGP04278 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SHBGP04278 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SHBGP04278 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SHBGP04278 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SHBGP04278 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SHBGP04278 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SHBGP04278 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SHBGP04278 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SHBGP04278 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SHBGP04278 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SHBGP04278 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SHBGP04278 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SHBGP04278 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SHBGP04278 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SHBGP04278 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SHBGP04278 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SHBGP04278 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SHBGP04278 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SHBGP04278 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SHBGP04278 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SHBGP04278 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SHBGP04278 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SHBGP04278 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SHBGP04278 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SHBGP04278 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SHBGP04278 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SHBGP04278 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SHBGP04278 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SHBGP04278 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SHBGP04278 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SHBGP04278 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SHBGP04278 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SHBGP04278 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SHBGP04278 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SHBGP04278 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SHBGP04278 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SHBGP04278 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SHBGP04278 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SHBGP04278 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SHBGP04278 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SHBGP04278 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SHBGP04278 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SHBGP04278 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SHBGP04278 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SHBGP04278 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SHBGP04278 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SHBGP04278 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms