Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOC1P02654 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOC1P02654 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
APOC1P02654 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOC1P02654 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
APOC1P02654 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOC1P02654 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOC1P02654 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOC1P02654 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
APOC1P02654 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
APOC1P02654 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
APOC1P02654 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
APOC1P02654 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOC1P02654 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOC1P02654 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOC1P02654 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOC1P02654 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOC1P02654 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOC1P02654 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOC1P02654 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOC1P02654 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APOC1P02654 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOC1P02654 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOC1P02654 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOC1P02654 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOC1P02654 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOC1P02654 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOC1P02654 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOC1P02654 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOC1P02654 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOC1P02654 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOC1P02654 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOC1P02654 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOC1P02654 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOC1P02654 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APOC1P02654 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
APOC1P02654 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOC1P02654 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOC1P02654 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOC1P02654 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOC1P02654 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
APOC1P02654 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOC1P02654 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOC1P02654 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOC1P02654 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOC1P02654 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
APOC1P02654 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOC1P02654 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOC1P02654 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOC1P02654 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOC1P02654 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOC1P02654 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOC1P02654 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOC1P02654 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOC1P02654 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOC1P02654 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOC1P02654 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOC1P02654 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOC1P02654 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOC1P02654 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOC1P02654 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOC1P02654 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOC1P02654 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOC1P02654 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOC1P02654 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
APOC1P02654 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOC1P02654 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOC1P02654 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOC1P02654 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOC1P02654 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOC1P02654 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOC1P02654 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOC1P02654 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOC1P02654 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOC1P02654 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOC1P02654 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOC1P02654 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOC1P02654 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
APOC1P02654 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOC1P02654 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOC1P02654 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOC1P02654 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOC1P02654 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOC1P02654 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOC1P02654 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOC1P02654 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOC1P02654 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOC1P02654 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOC1P02654 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
APOC1P02654 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOC1P02654 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOC1P02654 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOC1P02654 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOC1P02654 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOC1P02654 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOC1P02654 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOC1P02654 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOC1P02654 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOC1P02654 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOC1P02654 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms