Protein–RNA interactions for Protein: O95104

SCAF4, Splicing factor, arginine/serine-rich 15, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF4O95104 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCAF4O95104 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCAF4O95104 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCAF4O95104 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCAF4O95104 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCAF4O95104 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCAF4O95104 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SCAF4O95104 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCAF4O95104 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCAF4O95104 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCAF4O95104 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCAF4O95104 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCAF4O95104 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCAF4O95104 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCAF4O95104 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCAF4O95104 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCAF4O95104 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SCAF4O95104 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCAF4O95104 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCAF4O95104 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SCAF4O95104 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCAF4O95104 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SCAF4O95104 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCAF4O95104 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCAF4O95104 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCAF4O95104 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCAF4O95104 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCAF4O95104 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCAF4O95104 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCAF4O95104 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCAF4O95104 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCAF4O95104 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCAF4O95104 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCAF4O95104 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SCAF4O95104 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCAF4O95104 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SCAF4O95104 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCAF4O95104 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCAF4O95104 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCAF4O95104 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCAF4O95104 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCAF4O95104 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCAF4O95104 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCAF4O95104 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCAF4O95104 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCAF4O95104 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCAF4O95104 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCAF4O95104 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCAF4O95104 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCAF4O95104 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCAF4O95104 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCAF4O95104 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCAF4O95104 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCAF4O95104 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCAF4O95104 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCAF4O95104 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCAF4O95104 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCAF4O95104 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SCAF4O95104 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCAF4O95104 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCAF4O95104 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCAF4O95104 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCAF4O95104 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCAF4O95104 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCAF4O95104 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCAF4O95104 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCAF4O95104 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCAF4O95104 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCAF4O95104 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCAF4O95104 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCAF4O95104 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCAF4O95104 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCAF4O95104 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCAF4O95104 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCAF4O95104 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCAF4O95104 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCAF4O95104 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCAF4O95104 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCAF4O95104 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCAF4O95104 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SCAF4O95104 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCAF4O95104 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCAF4O95104 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCAF4O95104 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCAF4O95104 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCAF4O95104 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCAF4O95104 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCAF4O95104 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCAF4O95104 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCAF4O95104 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCAF4O95104 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCAF4O95104 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCAF4O95104 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCAF4O95104 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCAF4O95104 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCAF4O95104 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCAF4O95104 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCAF4O95104 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCAF4O95104 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCAF4O95104 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms