Protein–RNA interactions for Protein: O43818

RRP9, U3 small nucleolar RNA-interacting protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP9O43818 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RRP9O43818 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RRP9O43818 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RRP9O43818 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RRP9O43818 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RRP9O43818 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RRP9O43818 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RRP9O43818 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RRP9O43818 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RRP9O43818 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RRP9O43818 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RRP9O43818 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RRP9O43818 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RRP9O43818 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RRP9O43818 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RRP9O43818 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RRP9O43818 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RRP9O43818 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RRP9O43818 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RRP9O43818 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RRP9O43818 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RRP9O43818 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RRP9O43818 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RRP9O43818 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RRP9O43818 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RRP9O43818 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RRP9O43818 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RRP9O43818 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RRP9O43818 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RRP9O43818 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RRP9O43818 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RRP9O43818 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RRP9O43818 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RRP9O43818 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RRP9O43818 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RRP9O43818 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RRP9O43818 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RRP9O43818 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RRP9O43818 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RRP9O43818 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RRP9O43818 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RRP9O43818 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RRP9O43818 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RRP9O43818 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RRP9O43818 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RRP9O43818 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RRP9O43818 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RRP9O43818 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RRP9O43818 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RRP9O43818 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RRP9O43818 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RRP9O43818 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RRP9O43818 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RRP9O43818 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RRP9O43818 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RRP9O43818 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RRP9O43818 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RRP9O43818 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RRP9O43818 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RRP9O43818 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RRP9O43818 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RRP9O43818 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RRP9O43818 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RRP9O43818 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RRP9O43818 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RRP9O43818 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RRP9O43818 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RRP9O43818 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RRP9O43818 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RRP9O43818 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RRP9O43818 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RRP9O43818 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RRP9O43818 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RRP9O43818 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RRP9O43818 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RRP9O43818 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RRP9O43818 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RRP9O43818 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RRP9O43818 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RRP9O43818 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RRP9O43818 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RRP9O43818 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RRP9O43818 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RRP9O43818 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RRP9O43818 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RRP9O43818 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RRP9O43818 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RRP9O43818 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RRP9O43818 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RRP9O43818 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RRP9O43818 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RRP9O43818 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RRP9O43818 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RRP9O43818 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RRP9O43818 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RRP9O43818 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RRP9O43818 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RRP9O43818 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RRP9O43818 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RRP9O43818 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms