Protein–RNA interactions for Protein: O15020

SPTBN2, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN2O15020 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SPTBN2O15020 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SPTBN2O15020 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SPTBN2O15020 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPTBN2O15020 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPTBN2O15020 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SPTBN2O15020 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPTBN2O15020 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPTBN2O15020 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPTBN2O15020 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPTBN2O15020 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPTBN2O15020 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPTBN2O15020 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPTBN2O15020 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPTBN2O15020 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPTBN2O15020 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPTBN2O15020 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPTBN2O15020 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPTBN2O15020 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPTBN2O15020 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPTBN2O15020 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPTBN2O15020 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SPTBN2O15020 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPTBN2O15020 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPTBN2O15020 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPTBN2O15020 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPTBN2O15020 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPTBN2O15020 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPTBN2O15020 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPTBN2O15020 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPTBN2O15020 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPTBN2O15020 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPTBN2O15020 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SPTBN2O15020 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPTBN2O15020 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPTBN2O15020 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SPTBN2O15020 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SPTBN2O15020 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPTBN2O15020 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPTBN2O15020 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SPTBN2O15020 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPTBN2O15020 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPTBN2O15020 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPTBN2O15020 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPTBN2O15020 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPTBN2O15020 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPTBN2O15020 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SPTBN2O15020 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPTBN2O15020 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPTBN2O15020 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPTBN2O15020 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPTBN2O15020 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPTBN2O15020 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SPTBN2O15020 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPTBN2O15020 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPTBN2O15020 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPTBN2O15020 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPTBN2O15020 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPTBN2O15020 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPTBN2O15020 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPTBN2O15020 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPTBN2O15020 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SPTBN2O15020 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPTBN2O15020 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPTBN2O15020 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPTBN2O15020 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPTBN2O15020 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPTBN2O15020 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPTBN2O15020 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPTBN2O15020 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPTBN2O15020 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPTBN2O15020 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPTBN2O15020 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPTBN2O15020 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPTBN2O15020 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SPTBN2O15020 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPTBN2O15020 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPTBN2O15020 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPTBN2O15020 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPTBN2O15020 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPTBN2O15020 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPTBN2O15020 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SPTBN2O15020 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPTBN2O15020 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPTBN2O15020 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPTBN2O15020 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPTBN2O15020 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPTBN2O15020 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPTBN2O15020 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPTBN2O15020 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPTBN2O15020 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPTBN2O15020 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPTBN2O15020 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SPTBN2O15020 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SPTBN2O15020 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPTBN2O15020 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPTBN2O15020 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPTBN2O15020 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPTBN2O15020 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPTBN2O15020 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108 ms