Protein–RNA interactions for Protein: O00571

DDX3X, ATP-dependent RNA helicase DDX3X, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 662 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX3XO00571 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.142e-16■■■■■ 49.4
DDX3XO00571 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.782e-16■■■■■ 49.4
DDX3XO00571 PCYT2-207ENST00000571581 999 ntTSL 525.85■■□□□ 1.732e-16■■■■■ 49.4
DDX3XO00571 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.712e-16■■■■■ 49.4
DDX3XO00571 PCYT2-213ENST00000573401 1028 ntTSL 525.32■■□□□ 1.642e-16■■■■■ 49.4
DDX3XO00571 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.493e-10■■■■■ 49.4
DDX3XO00571 PCYT2-214ENST00000573636 913 ntTSL 523.98■■□□□ 1.432e-16■■■■■ 49.4
DDX3XO00571 PCYT2-218ENST00000576343 1006 ntTSL 521.77■■□□□ 1.082e-16■■■■■ 49.4
DDX3XO00571 PCYT2-210ENST00000572473 575 ntTSL 521.47■■□□□ 1.032e-16■■■■■ 49.4
DDX3XO00571 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.529e-18■■■■■ 49.3
DDX3XO00571 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.419e-18■■■■■ 49.3
DDX3XO00571 NIPSNAP2-208ENST00000470036 497 ntTSL 220.03■□□□□ 0.89e-18■■■■■ 49.3
DDX3XO00571 NIPSNAP2-206ENST00000456204 660 ntTSL 37.92□□□□□ -1.149e-18■■■■■ 49.3
DDX3XO00571 PDIK1L-203ENST00000444713 838 ntTSL 313.52□□□□□ -0.251e-6■■■■■ 49.3
DDX3XO00571 PDIK1L-204ENST00000619836 4252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.421e-6■■■■■ 49.3
DDX3XO00571 PDIK1L-201ENST00000374269 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.991e-6■■■■■ 49.3
DDX3XO00571 PDIK1L-202ENST00000374271 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.071e-6■■■■■ 49.3
DDX3XO00571 TXNL4A-207ENST00000586825 586 ntTSL 326.58■■□□□ 1.856e-24■■■■■ 49.2
DDX3XO00571 TBC1D14-208ENST00000451522 4149 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.131e-6■■■■■ 49.2
DDX3XO00571 TBC1D14-202ENST00000410031 4201 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.671e-6■■■■■ 49.2
DDX3XO00571 KCTD20-201ENST00000265344 1339 ntTSL 219.73■□□□□ 0.753e-17■■■■■ 49.2
DDX3XO00571 KCTD20-205ENST00000460983 597 ntTSL 418.35■□□□□ 0.533e-17■■■■■ 49.2
DDX3XO00571 KCTD20-204ENST00000449081 4094 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.433e-17■■■■■ 49.2
DDX3XO00571 CDHR2-205ENST00000510124 575 ntTSL 522.42■■□□□ 1.189e-10■■■■■ 49.1
DDX3XO00571 CDHR2-206ENST00000510636 4509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.569e-10■■■■■ 49.1
DDX3XO00571 CDHR2-201ENST00000261944 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.719e-10■■■■■ 49.1
DDX3XO00571 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.59e-8■■■■■ 49
DDX3XO00571 PHF5A-201ENST00000216252 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.034e-8■■■■■ 49
DDX3XO00571 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.415e-13■■■■■ 49
DDX3XO00571 TMEM147-209ENST00000599895 1045 ntTSL 515.97■□□□□ 0.155e-13■■■■■ 49
DDX3XO00571 SLC35F6-204ENST00000482746 528 ntTSL 219.23■□□□□ 0.672e-12■■■■■ 48.9
DDX3XO00571 SLC35F6-201ENST00000344420 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.432e-12■■■■■ 48.9
DDX3XO00571 SLC35F6-203ENST00000429494 3738 ntTSL 1 (best)11.71□□□□□ -0.532e-12■■■■■ 48.9
DDX3XO00571 SLC35F6-202ENST00000414029 3605 ntTSL 1 (best)9.95□□□□□ -0.822e-12■■■■■ 48.9
DDX3XO00571 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.473e-11■■■■■ 48.9
DDX3XO00571 INHA-202ENST00000489456 645 ntTSL 214.5□□□□□ -0.093e-11■■■■■ 48.9
DDX3XO00571 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.351e-7■■■■■ 48.8
DDX3XO00571 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.261e-7■■■■■ 48.8
DDX3XO00571 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.183e-6■■■■■ 48.8
DDX3XO00571 TMEM184A-203ENST00000319018 4374 ntTSL 515.77■□□□□ 0.113e-6■■■■■ 48.8
DDX3XO00571 ZNF252P-205ENST00000528392 599 ntTSL 4 BASIC11.2□□□□□ -0.624e-8■■■■■ 48.7
DDX3XO00571 ZNF252P-207ENST00000534037 1112 ntTSL 1 (best)11.03□□□□□ -0.644e-8■■■■■ 48.7
DDX3XO00571 ZNF252P-204ENST00000528327 1822 ntTSL 210.44□□□□□ -0.744e-8■■■■■ 48.7
DDX3XO00571 ZNF252P-203ENST00000527222 876 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.884e-8■■■■■ 48.7
DDX3XO00571 ZNF252P-206ENST00000529315 575 ntTSL 58.66□□□□□ -1.024e-8■■■■■ 48.7
DDX3XO00571 ZNF252P-201ENST00000426361 5210 ntTSL 4 BASIC8.63□□□□□ -1.034e-8■■■■■ 48.7
DDX3XO00571 TFG-205ENST00000479672 776 ntTSL 324.18■■□□□ 1.463e-9■■■■■ 48.5
DDX3XO00571 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.283e-9■■■■■ 48.5
DDX3XO00571 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.073e-9■■■■■ 48.5
DDX3XO00571 TFG-203ENST00000463568 723 ntTSL 317.99■□□□□ 0.473e-9■■■■■ 48.5
DDX3XO00571 TFG-202ENST00000418917 1716 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.183e-9■■■■■ 48.5
DDX3XO00571 TFG-208ENST00000490574 1696 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.33e-9■■■■■ 48.5
DDX3XO00571 TFG-204ENST00000476228 1783 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.133e-9■■■■■ 48.5
DDX3XO00571 AHNAK-207ENST00000531324 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 319.37■□□□□ 0.691e-11■■■■■ 48.5
DDX3XO00571 AHNAK-206ENST00000530285 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 314.66□□□□□ -0.061e-11■■■■■ 48.5
DDX3XO00571 M6PR-209ENST00000543704 616 ntTSL 312.78□□□□□ -0.361e-9■■■■■ 48.5
DDX3XO00571 M6PR-207ENST00000543159 720 ntTSL 210.08□□□□□ -0.81e-9■■■■■ 48.5
DDX3XO00571 GNPNAT1-205ENST00000557604 785 ntTSL 322.59■■□□□ 1.214e-8■■■■■ 48.5
DDX3XO00571 GNPNAT1-201ENST00000216410 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.174e-8■■■■■ 48.5
DDX3XO00571 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.451e-8■■■■■ 48.5
DDX3XO00571 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.195e-9■■■■■ 48.4
DDX3XO00571 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.115e-9■■■■■ 48.4
DDX3XO00571 ZNF511-204ENST00000482153 807 ntTSL 218.94■□□□□ 0.625e-9■■■■■ 48.4
DDX3XO00571 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.552e-32■■■■■ 48.4
DDX3XO00571 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.191e-6■■■■■ 48.4
DDX3XO00571 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.061e-6■■■■■ 48.4
DDX3XO00571 EIF6-208ENST00000462894 453 ntTSL 325.88■■□□□ 1.733e-23■■■■■ 48.4
DDX3XO00571 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.163e-23■■■■■ 48.4
DDX3XO00571 EIF6-205ENST00000440766 798 ntTSL 216.81■□□□□ 0.283e-23■■■■■ 48.4
DDX3XO00571 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.133e-23■■■■■ 48.4
DDX3XO00571 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.312e-12■■■■■ 48.3
DDX3XO00571 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.142e-6■■■■■ 48.3
DDX3XO00571 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 28e-11■■■■■ 48.3
DDX3XO00571 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.872e-12■■■■■ 48.3
DDX3XO00571 COQ2-203ENST00000503391 1304 ntTSL 226.51■■□□□ 1.838e-11■■■■■ 48.3
DDX3XO00571 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.668e-11■■■■■ 48.3
DDX3XO00571 PLPPR3-203ENST00000519502 782 ntTSL 225.37■■□□□ 1.652e-12■■■■■ 48.3
DDX3XO00571 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.388e-11■■■■■ 48.3
DDX3XO00571 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.162e-6■■■■■ 48.3
DDX3XO00571 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.063e-21■■■■■ 48.3
DDX3XO00571 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.858e-11■■■■■ 48.3
DDX3XO00571 TRMT61A-201ENST00000299202 2827 ntTSL 1 (best)18.1■□□□□ 0.494e-10■■■■■ 48.3
DDX3XO00571 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.058e-11■■■■■ 48.3
DDX3XO00571 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.012e-6■■■■■ 48.3
DDX3XO00571 TRMT61A-202ENST00000389749 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.094e-10■■■■■ 48.3
DDX3XO00571 LTBP3-218ENST00000530866 3756 ntTSL 213.55□□□□□ -0.247e-11■■■■■ 48.3
DDX3XO00571 LRG1-201ENST00000306390 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.268e-11■■■■■ 48.3
DDX3XO00571 WDSUB1-204ENST00000409124 1600 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.292e-6■■■■■ 48.3
DDX3XO00571 FBXO34-203ENST00000554940 577 ntTSL 412.42□□□□□ -0.428e-11■■■■■ 48.3
DDX3XO00571 CAVIN2-201ENST00000304141 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.692e-30■■■■■ 48.3
DDX3XO00571 LRG1-202ENST00000586883 571 ntTSL 410.19□□□□□ -0.788e-11■■■■■ 48.3
DDX3XO00571 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.498e-11■■■■■ 48.3
DDX3XO00571 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.246e-12■■■■■ 48.2
DDX3XO00571 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.141e-12■■■■■ 48.2
DDX3XO00571 RHNO1-205ENST00000535978 543 ntTSL 419.13■□□□□ 0.651e-12■■■■■ 48.2
DDX3XO00571 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.581e-12■■■■■ 48.2
DDX3XO00571 RHNO1-203ENST00000464682 1605 ntTSL 217.18■□□□□ 0.341e-12■■■■■ 48.2
DDX3XO00571 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.231e-12■■■■■ 48.2
DDX3XO00571 RHNO1-207ENST00000538636 583 ntTSL 415.26■□□□□ 0.031e-12■■■■■ 48.2
DDX3XO00571 TULP3-205ENST00000540184 978 ntTSL 514.92□□□□□ -0.021e-12■■■■■ 48.2
Retrieved 100 of 47,714 protein–RNA pairs in 2229.5 ms