Protein–RNA interactions for Protein: I3L3M4

Claudin, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
I3L3M4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
I3L3M4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
I3L3M4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
I3L3M4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
I3L3M4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
I3L3M4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
I3L3M4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
I3L3M4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
I3L3M4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
I3L3M4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
I3L3M4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
I3L3M4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
I3L3M4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
I3L3M4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
I3L3M4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
I3L3M4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
I3L3M4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
I3L3M4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
I3L3M4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
I3L3M4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
I3L3M4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
I3L3M4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
I3L3M4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
I3L3M4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
I3L3M4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
I3L3M4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
I3L3M4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
I3L3M4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
I3L3M4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
I3L3M4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
I3L3M4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
I3L3M4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
I3L3M4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
I3L3M4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
I3L3M4 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
I3L3M4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
I3L3M4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
I3L3M4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
I3L3M4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
I3L3M4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
I3L3M4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
I3L3M4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
I3L3M4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
I3L3M4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
I3L3M4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
I3L3M4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
I3L3M4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
I3L3M4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
I3L3M4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
I3L3M4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
I3L3M4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
I3L3M4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
I3L3M4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
I3L3M4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
I3L3M4 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
I3L3M4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
I3L3M4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
I3L3M4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
I3L3M4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
I3L3M4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
I3L3M4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
I3L3M4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
I3L3M4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
I3L3M4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
I3L3M4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
I3L3M4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
I3L3M4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
I3L3M4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
I3L3M4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
I3L3M4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
I3L3M4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
I3L3M4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
I3L3M4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
I3L3M4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
I3L3M4 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
I3L3M4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
I3L3M4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
I3L3M4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
I3L3M4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
I3L3M4 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
I3L3M4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
I3L3M4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
I3L3M4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
I3L3M4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
I3L3M4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
I3L3M4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
I3L3M4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
I3L3M4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
I3L3M4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
I3L3M4 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
I3L3M4 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
I3L3M4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
I3L3M4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
I3L3M4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
I3L3M4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
I3L3M4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
I3L3M4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
I3L3M4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
I3L3M4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
I3L3M4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms