Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC69A6NI79 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC69A6NI79 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC69A6NI79 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC69A6NI79 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC69A6NI79 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC69A6NI79 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC69A6NI79 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC69A6NI79 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC69A6NI79 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC69A6NI79 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC69A6NI79 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC69A6NI79 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC69A6NI79 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC69A6NI79 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC69A6NI79 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC69A6NI79 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC69A6NI79 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC69A6NI79 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC69A6NI79 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC69A6NI79 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC69A6NI79 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC69A6NI79 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC69A6NI79 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC69A6NI79 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC69A6NI79 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC69A6NI79 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC69A6NI79 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC69A6NI79 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC69A6NI79 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC69A6NI79 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC69A6NI79 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC69A6NI79 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC69A6NI79 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC69A6NI79 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC69A6NI79 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC69A6NI79 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC69A6NI79 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC69A6NI79 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC69A6NI79 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC69A6NI79 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC69A6NI79 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC69A6NI79 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC69A6NI79 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC69A6NI79 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC69A6NI79 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC69A6NI79 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC69A6NI79 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC69A6NI79 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC69A6NI79 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC69A6NI79 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC69A6NI79 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC69A6NI79 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC69A6NI79 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC69A6NI79 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC69A6NI79 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC69A6NI79 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC69A6NI79 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC69A6NI79 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC69A6NI79 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC69A6NI79 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC69A6NI79 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC69A6NI79 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC69A6NI79 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CCDC69A6NI79 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC69A6NI79 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CCDC69A6NI79 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CCDC69A6NI79 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC69A6NI79 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC69A6NI79 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC69A6NI79 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC69A6NI79 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC69A6NI79 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC69A6NI79 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC69A6NI79 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC69A6NI79 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC69A6NI79 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC69A6NI79 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC69A6NI79 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC69A6NI79 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC69A6NI79 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC69A6NI79 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC69A6NI79 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC69A6NI79 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC69A6NI79 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC69A6NI79 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC69A6NI79 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC69A6NI79 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC69A6NI79 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC69A6NI79 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC69A6NI79 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC69A6NI79 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC69A6NI79 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC69A6NI79 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC69A6NI79 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC69A6NI79 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC69A6NI79 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC69A6NI79 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC69A6NI79 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC69A6NI79 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms