Protein–RNA interactions for Protein: A6NFR6

C5orf60, Putative uncharacterized protein C5orf60, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf60A6NFR6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C5orf60A6NFR6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
C5orf60A6NFR6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C5orf60A6NFR6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
C5orf60A6NFR6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C5orf60A6NFR6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C5orf60A6NFR6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C5orf60A6NFR6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C5orf60A6NFR6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C5orf60A6NFR6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C5orf60A6NFR6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C5orf60A6NFR6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C5orf60A6NFR6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C5orf60A6NFR6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C5orf60A6NFR6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C5orf60A6NFR6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C5orf60A6NFR6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C5orf60A6NFR6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C5orf60A6NFR6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C5orf60A6NFR6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C5orf60A6NFR6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C5orf60A6NFR6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C5orf60A6NFR6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C5orf60A6NFR6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C5orf60A6NFR6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C5orf60A6NFR6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C5orf60A6NFR6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C5orf60A6NFR6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C5orf60A6NFR6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C5orf60A6NFR6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C5orf60A6NFR6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C5orf60A6NFR6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C5orf60A6NFR6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C5orf60A6NFR6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C5orf60A6NFR6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C5orf60A6NFR6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C5orf60A6NFR6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C5orf60A6NFR6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C5orf60A6NFR6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
C5orf60A6NFR6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C5orf60A6NFR6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C5orf60A6NFR6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C5orf60A6NFR6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
C5orf60A6NFR6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
C5orf60A6NFR6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
C5orf60A6NFR6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C5orf60A6NFR6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C5orf60A6NFR6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
C5orf60A6NFR6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
C5orf60A6NFR6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C5orf60A6NFR6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C5orf60A6NFR6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C5orf60A6NFR6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C5orf60A6NFR6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C5orf60A6NFR6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C5orf60A6NFR6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C5orf60A6NFR6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
C5orf60A6NFR6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C5orf60A6NFR6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C5orf60A6NFR6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C5orf60A6NFR6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C5orf60A6NFR6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C5orf60A6NFR6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C5orf60A6NFR6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C5orf60A6NFR6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C5orf60A6NFR6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C5orf60A6NFR6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C5orf60A6NFR6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C5orf60A6NFR6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C5orf60A6NFR6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C5orf60A6NFR6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C5orf60A6NFR6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
C5orf60A6NFR6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C5orf60A6NFR6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C5orf60A6NFR6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C5orf60A6NFR6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C5orf60A6NFR6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C5orf60A6NFR6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C5orf60A6NFR6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C5orf60A6NFR6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C5orf60A6NFR6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C5orf60A6NFR6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C5orf60A6NFR6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C5orf60A6NFR6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C5orf60A6NFR6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C5orf60A6NFR6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C5orf60A6NFR6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C5orf60A6NFR6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C5orf60A6NFR6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C5orf60A6NFR6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C5orf60A6NFR6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C5orf60A6NFR6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C5orf60A6NFR6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
C5orf60A6NFR6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
C5orf60A6NFR6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C5orf60A6NFR6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C5orf60A6NFR6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C5orf60A6NFR6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C5orf60A6NFR6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C5orf60A6NFR6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms