Protein–RNA interactions for Protein: Q12516

SRF1, Regulator of phospholipase D SRF1, yeastyeast

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Length 437 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SRF1Q12516 TRM9YML014W 840 nt13.96□□□□□ -0.17
SRF1Q12516 INM2YDR287W 879 nt13.92□□□□□ -0.18
SRF1Q12516 ARE1YCR048W 1833 nt13.92□□□□□ -0.18
SRF1Q12516 YBL100CYBL100C 315 nt13.91□□□□□ -0.18
SRF1Q12516 PUT4YOR348C 1884 nt13.88□□□□□ -0.19
SRF1Q12516 SBA1YKL117W 651 nt13.86□□□□□ -0.19
SRF1Q12516 YDR433WYDR433W 441 nt13.83□□□□□ -0.2
SRF1Q12516 IDH1YNL037C 1083 nt13.82□□□□□ -0.2
SRF1Q12516 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.81□□□□□ -0.2
SRF1Q12516 YKR040CYKR040C 504 nt13.81□□□□□ -0.2
SRF1Q12516 FPR4YLR449W 1179 nt13.8□□□□□ -0.2
SRF1Q12516 YJL152WYJL152W 360 nt13.79□□□□□ -0.2
SRF1Q12516 FUN26YAL022C 1554 nt13.76□□□□□ -0.21
SRF1Q12516 NAB2YGL122C 1578 nt13.71□□□□□ -0.22
SRF1Q12516 DAL1YIR027C 1383 nt13.7□□□□□ -0.22
SRF1Q12516 CCT6YDR188W 1641 nt13.68□□□□□ -0.22
SRF1Q12516 BUD23YCR047C 828 nt13.64□□□□□ -0.23
SRF1Q12516 POA1YBR022W 534 nt13.61□□□□□ -0.23
SRF1Q12516 SUF2tP(AGG)C 72 nt13.6□□□□□ -0.23
SRF1Q12516 SUF10tP(AGG)N 72 nt13.6□□□□□ -0.23
SRF1Q12516 GBP2YCL011C 1284 nt13.56□□□□□ -0.24
SRF1Q12516 PHO4YFR034C 939 nt13.54□□□□□ -0.24
SRF1Q12516 MXR2YCL033C 507 nt13.54□□□□□ -0.24
SRF1Q12516 FIS1YIL065C 468 nt13.51□□□□□ -0.25
SRF1Q12516 YGR139WYGR139W 339 nt13.5□□□□□ -0.25
SRF1Q12516 PAU16YKL224C 372 nt13.47□□□□□ -0.25
SRF1Q12516 ALF1YNL148C 765 nt13.47□□□□□ -0.25
SRF1Q12516 RRT5YFR032C 870 nt13.4□□□□□ -0.26
SRF1Q12516 YKL030WYKL030W 606 nt13.36□□□□□ -0.27
SRF1Q12516 PTH1YHR189W 573 nt13.29□□□□□ -0.28
SRF1Q12516 YPS1YLR120C 1710 nt13.28□□□□□ -0.28
SRF1Q12516 TCD2YKL027W 1344 nt13.28□□□□□ -0.28
SRF1Q12516 YLR235CYLR235C 399 nt13.27□□□□□ -0.29
SRF1Q12516 YFR018CYFR018C 1092 nt13.25□□□□□ -0.29
SRF1Q12516 SNF6YHL025W 999 nt13.2□□□□□ -0.3
SRF1Q12516 FRD1YEL047C 1413 nt13.2□□□□□ -0.3
SRF1Q12516 TIR4YOR009W 1464 nt13.18□□□□□ -0.3
SRF1Q12516 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt13.18□□□□□ -0.3
SRF1Q12516 LCB1YMR296C 1677 nt13.15□□□□□ -0.3
SRF1Q12516 CAC2YML102W 1407 nt13.13□□□□□ -0.31
SRF1Q12516 PRE6YOL038W 765 nt13.13□□□□□ -0.31
SRF1Q12516 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt13.09□□□□□ -0.31
SRF1Q12516 YCL042WYCL042W 360 nt13.09□□□□□ -0.31
SRF1Q12516 NAT4YMR069W 858 nt13.04□□□□□ -0.32
SRF1Q12516 YDR095CYDR095C 411 nt12.99□□□□□ -0.33
SRF1Q12516 YMR057CYMR057C 372 nt12.98□□□□□ -0.33
SRF1Q12516 TIM23YNR017W 669 nt12.95□□□□□ -0.34
SRF1Q12516 DED1YOR204W 1815 nt12.95□□□□□ -0.34
SRF1Q12516 DIC1YLR348C 897 nt12.94□□□□□ -0.34
SRF1Q12516 YMR244WYMR244W 1068 nt12.92□□□□□ -0.34
SRF1Q12516 GLK1YCL040W 1503 nt12.88□□□□□ -0.35
SRF1Q12516 SOR2YDL246C 1074 nt12.87□□□□□ -0.35
SRF1Q12516 SOR1YJR159W 1074 nt12.87□□□□□ -0.35
SRF1Q12516 PET9YBL030C 957 nt12.87□□□□□ -0.35
SRF1Q12516 RRD1YIL153W 1182 nt12.86□□□□□ -0.35
SRF1Q12516 ART5YGR068C 1761 nt12.84□□□□□ -0.35
SRF1Q12516 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.83□□□□□ -0.36
SRF1Q12516 RPP2AYOL039W 321 nt12.8□□□□□ -0.36
SRF1Q12516 YPR064WYPR064W 420 nt12.79□□□□□ -0.36
SRF1Q12516 YFL066CYFL066C 1179 nt12.77□□□□□ -0.37
SRF1Q12516 MSF1YPR047W 1410 nt12.77□□□□□ -0.37
SRF1Q12516 FMT1YBL013W 1206 nt12.75□□□□□ -0.37
SRF1Q12516 GLR1YPL091W 1452 nt12.73□□□□□ -0.37
SRF1Q12516 YLR179CYLR179C 606 nt12.73□□□□□ -0.37
SRF1Q12516 TAD3YLR316C 969 nt12.71□□□□□ -0.37
SRF1Q12516 PEX25YPL112C 1185 nt12.7□□□□□ -0.38
SRF1Q12516 RBG2YGR173W 1107 nt12.67□□□□□ -0.38
SRF1Q12516 GFD2YCL036W 1701 nt12.66□□□□□ -0.38
SRF1Q12516 CWP1YKL096W 720 nt12.65□□□□□ -0.38
SRF1Q12516 THI74YDR438W 1113 nt12.64□□□□□ -0.39
SRF1Q12516 RPM1RPM1 483 nt12.59□□□□□ -0.39
SRF1Q12516 NME1NME1 340 nt12.59□□□□□ -0.39
SRF1Q12516 FMP52YER004W 696 nt12.58□□□□□ -0.4
SRF1Q12516 FPS1YLL043W 2010 nt12.58□□□□□ -0.4
SRF1Q12516 PTP1YDL230W 1008 nt12.54□□□□□ -0.4
SRF1Q12516 ADH2YMR303C 1047 nt12.52□□□□□ -0.41
SRF1Q12516 YNL115CYNL115C 1935 nt12.52□□□□□ -0.41
SRF1Q12516 MIR1YJR077C 936 nt12.51□□□□□ -0.41
SRF1Q12516 WSC2YNL283C 1512 nt12.49□□□□□ -0.41
SRF1Q12516 AHT1YHR093W 549 nt12.49□□□□□ -0.41
SRF1Q12516 YSP3YOR003W 1437 nt12.44□□□□□ -0.42
SRF1Q12516 RTS2YOR077W 699 nt12.43□□□□□ -0.42
SRF1Q12516 SAM1YLR180W 1149 nt12.41□□□□□ -0.42
SRF1Q12516 YLR415CYLR415C 339 nt12.4□□□□□ -0.42
SRF1Q12516 NDI1YML120C 1542 nt12.39□□□□□ -0.43
SRF1Q12516 BDH1YAL060W 1149 nt12.39□□□□□ -0.43
SRF1Q12516 DAT1YML113W 747 nt12.39□□□□□ -0.43
SRF1Q12516 YGL034CYGL034C 366 nt12.37□□□□□ -0.43
SRF1Q12516 RNQ1YCL028W 1218 nt12.35□□□□□ -0.43
SRF1Q12516 YMR226CYMR226C 804 nt12.34□□□□□ -0.43
SRF1Q12516 VPS75YNL246W 795 nt12.33□□□□□ -0.44
SRF1Q12516 PAU7YAR020C 168 nt12.3□□□□□ -0.44
SRF1Q12516 CUE1YMR264W 612 nt12.3□□□□□ -0.44
SRF1Q12516 PCM1YEL058W 1674 nt12.26□□□□□ -0.45
SRF1Q12516 RAD51YER095W 1203 nt12.26□□□□□ -0.45
SRF1Q12516 YIH1YCR059C 777 nt12.25□□□□□ -0.45
SRF1Q12516 RBG1YAL036C 1110 nt12.25□□□□□ -0.45
SRF1Q12516 YIL100WYIL100W 354 nt12.24□□□□□ -0.45
SRF1Q12516 AQY1YPR192W 918 nt12.24□□□□□ -0.45
SRF1Q12516 YSC84YHR016C 1407 nt12.23□□□□□ -0.45
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