Protein–RNA interactions for Protein: Q12428

PDH1, Probable 2-methylcitrate dehydratase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PDH1Q12428 CCT6YDR188W 1641 nt12.6□□□□□ -0.39
PDH1Q12428 MRPL8YJL063C 717 nt12.6□□□□□ -0.39
PDH1Q12428 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.49□□□□□ -0.41
PDH1Q12428 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.49□□□□□ -0.41
PDH1Q12428 ALF1YNL148C 765 nt12.46□□□□□ -0.41
PDH1Q12428 YJL152WYJL152W 360 nt12.43□□□□□ -0.42
PDH1Q12428 ADO1YJR105W 1023 nt12.42□□□□□ -0.42
PDH1Q12428 LPX1YOR084W 1164 nt12.4□□□□□ -0.42
PDH1Q12428 ERV46YAL042W 1248 nt12.37□□□□□ -0.43
PDH1Q12428 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt12.35□□□□□ -0.43
PDH1Q12428 YEL076CYEL076C 651 nt12.35□□□□□ -0.43
PDH1Q12428 YLR464WYLR464W 651 nt12.35□□□□□ -0.43
PDH1Q12428 IDH1YNL037C 1083 nt12.35□□□□□ -0.43
PDH1Q12428 SPP1YPL138C 1062 nt12.34□□□□□ -0.43
PDH1Q12428 YDR433WYDR433W 441 nt12.28□□□□□ -0.44
PDH1Q12428 YDR095CYDR095C 411 nt12.27□□□□□ -0.45
PDH1Q12428 UBX6YJL048C 1191 nt12.27□□□□□ -0.45
PDH1Q12428 RTG1YOL067C 534 nt12.27□□□□□ -0.45
PDH1Q12428 YPS1YLR120C 1710 nt12.26□□□□□ -0.45
PDH1Q12428 YKR040CYKR040C 504 nt12.25□□□□□ -0.45
PDH1Q12428 SIS1YNL007C 1059 nt12.25□□□□□ -0.45
PDH1Q12428 GBP2YCL011C 1284 nt12.19□□□□□ -0.46
PDH1Q12428 TIR4YOR009W 1464 nt12.16□□□□□ -0.46
PDH1Q12428 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.13□□□□□ -0.47
PDH1Q12428 MXR2YCL033C 507 nt12.11□□□□□ -0.47
PDH1Q12428 HUA1YGR268C 597 nt12.07□□□□□ -0.48
PDH1Q12428 RPP2AYOL039W 321 nt12.06□□□□□ -0.48
PDH1Q12428 SPT5YML010W 3192 nt12.06□□□□□ -0.48
PDH1Q12428 CAC2YML102W 1407 nt12.04□□□□□ -0.48
PDH1Q12428 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.01□□□□□ -0.49
PDH1Q12428 YMR057CYMR057C 372 nt12□□□□□ -0.49
PDH1Q12428 ART5YGR068C 1761 nt12□□□□□ -0.49
PDH1Q12428 YDR094WYDR094W 336 nt11.99□□□□□ -0.49
PDH1Q12428 PET9YBL030C 957 nt11.99□□□□□ -0.49
PDH1Q12428 TCD2YKL027W 1344 nt11.98□□□□□ -0.49
PDH1Q12428 PTP1YDL230W 1008 nt11.93□□□□□ -0.5
PDH1Q12428 GFD2YCL036W 1701 nt11.89□□□□□ -0.51
PDH1Q12428 FRD1YEL047C 1413 nt11.87□□□□□ -0.51
PDH1Q12428 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt11.86□□□□□ -0.51
PDH1Q12428 MEP2YNL142W 1500 nt11.84□□□□□ -0.51
PDH1Q12428 DED1YOR204W 1815 nt11.83□□□□□ -0.52
PDH1Q12428 PTH1YHR189W 573 nt11.8□□□□□ -0.52
PDH1Q12428 RRD1YIL153W 1182 nt11.8□□□□□ -0.52
PDH1Q12428 YKL030WYKL030W 606 nt11.79□□□□□ -0.52
PDH1Q12428 YLR235CYLR235C 399 nt11.77□□□□□ -0.53
PDH1Q12428 YCL042WYCL042W 360 nt11.77□□□□□ -0.53
PDH1Q12428 FPS1YLL043W 2010 nt11.74□□□□□ -0.53
PDH1Q12428 SSA4YER103W 1929 nt11.72□□□□□ -0.53
PDH1Q12428 SOR2YDL246C 1074 nt11.7□□□□□ -0.54
PDH1Q12428 SOR1YJR159W 1074 nt11.7□□□□□ -0.54
PDH1Q12428 FMT1YBL013W 1206 nt11.69□□□□□ -0.54
PDH1Q12428 RTS2YOR077W 699 nt11.69□□□□□ -0.54
PDH1Q12428 LCB1YMR296C 1677 nt11.68□□□□□ -0.54
PDH1Q12428 DCW1YKL046C 1350 nt11.66□□□□□ -0.54
PDH1Q12428 CUE1YMR264W 612 nt11.59□□□□□ -0.55
PDH1Q12428 FMP52YER004W 696 nt11.58□□□□□ -0.56
PDH1Q12428 IRC15YPL017C 1500 nt11.57□□□□□ -0.56
PDH1Q12428 EMI2YDR516C 1503 nt11.55□□□□□ -0.56
PDH1Q12428 CWP1YKL096W 720 nt11.55□□□□□ -0.56
PDH1Q12428 PAU16YKL224C 372 nt11.55□□□□□ -0.56
PDH1Q12428 YFR018CYFR018C 1092 nt11.53□□□□□ -0.56
PDH1Q12428 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt11.52□□□□□ -0.57
PDH1Q12428 SBA1YKL117W 651 nt11.52□□□□□ -0.57
PDH1Q12428 YDL221WYDL221W 552 nt11.51□□□□□ -0.57
PDH1Q12428 RRT5YFR032C 870 nt11.51□□□□□ -0.57
PDH1Q12428 TIM23YNR017W 669 nt11.5□□□□□ -0.57
PDH1Q12428 ADH2YMR303C 1047 nt11.49□□□□□ -0.57
PDH1Q12428 YIL100WYIL100W 354 nt11.47□□□□□ -0.57
PDH1Q12428 GIS3YLR094C 1509 nt11.46□□□□□ -0.57
PDH1Q12428 YMR090WYMR090W 684 nt11.46□□□□□ -0.57
PDH1Q12428 DIC1YLR348C 897 nt11.44□□□□□ -0.58
PDH1Q12428 PRE6YOL038W 765 nt11.43□□□□□ -0.58
PDH1Q12428 YLR179CYLR179C 606 nt11.41□□□□□ -0.58
PDH1Q12428 YPR064WYPR064W 420 nt11.4□□□□□ -0.58
PDH1Q12428 SNF6YHL025W 999 nt11.37□□□□□ -0.59
PDH1Q12428 PCM1YEL058W 1674 nt11.36□□□□□ -0.59
PDH1Q12428 TAD3YLR316C 969 nt11.35□□□□□ -0.59
PDH1Q12428 RNQ1YCL028W 1218 nt11.32□□□□□ -0.6
PDH1Q12428 BDF1YLR399C 2061 nt11.3□□□□□ -0.6
PDH1Q12428 SCC4YER147C 1875 nt11.29□□□□□ -0.6
PDH1Q12428 WSC2YNL283C 1512 nt11.29□□□□□ -0.6
PDH1Q12428 YIH1YCR059C 777 nt11.28□□□□□ -0.6
PDH1Q12428 AHT1YHR093W 549 nt11.28□□□□□ -0.6
PDH1Q12428 SDH1YKL148C 1923 nt11.26□□□□□ -0.61
PDH1Q12428 YFL066CYFL066C 1179 nt11.24□□□□□ -0.61
PDH1Q12428 YBR220CYBR220C 1683 nt11.24□□□□□ -0.61
PDH1Q12428 NAT4YMR069W 858 nt11.21□□□□□ -0.61
PDH1Q12428 PEX25YPL112C 1185 nt11.21□□□□□ -0.61
PDH1Q12428 YNL195CYNL195C 786 nt11.16□□□□□ -0.62
PDH1Q12428 YLL053CYLL053C 459 nt11.15□□□□□ -0.62
PDH1Q12428 AQY1YPR192W 918 nt11.15□□□□□ -0.62
PDH1Q12428 TAT1YBR069C 1860 nt11.13□□□□□ -0.63
PDH1Q12428 YSC84YHR016C 1407 nt11.13□□□□□ -0.63
PDH1Q12428 YSP3YOR003W 1437 nt11.13□□□□□ -0.63
PDH1Q12428 GLK1YCL040W 1503 nt11.13□□□□□ -0.63
PDH1Q12428 BDH1YAL060W 1149 nt11.12□□□□□ -0.63
PDH1Q12428 FTR1YER145C 1215 nt11.11□□□□□ -0.63
PDH1Q12428 YNL115CYNL115C 1935 nt11.11□□□□□ -0.63
PDH1Q12428 YLR415CYLR415C 339 nt11.09□□□□□ -0.63
PDH1Q12428 BIO4YNR057C 714 nt11.07□□□□□ -0.64
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