Protein–RNA interactions for Protein: Q12200

NCR1, NPC intracellular cholesterol transporter 1-related protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NCR1Q12200 TRM9YML014W 840 nt13.81□□□□□ -0.2
NCR1Q12200 MOT3YMR070W 1473 nt13.79□□□□□ -0.2
NCR1Q12200 CCT6YDR188W 1641 nt13.74□□□□□ -0.21
NCR1Q12200 BMT5YIL096C 1011 nt13.72□□□□□ -0.21
NCR1Q12200 WHI5YOR083W 888 nt13.72□□□□□ -0.21
NCR1Q12200 PUS2YGL063W 1113 nt13.7□□□□□ -0.22
NCR1Q12200 REG2YBR050C 1017 nt13.67□□□□□ -0.22
NCR1Q12200 BUR6YER159C 429 nt13.66□□□□□ -0.22
NCR1Q12200 YPS1YLR120C 1710 nt13.66□□□□□ -0.22
NCR1Q12200 SPT5YML010W 3192 nt13.65□□□□□ -0.23
NCR1Q12200 SEM1YDR363W-A 270 nt13.64□□□□□ -0.23
NCR1Q12200 Q0182Q0182 405 nt13.63□□□□□ -0.23
NCR1Q12200 YDR095CYDR095C 411 nt13.6□□□□□ -0.23
NCR1Q12200 YPR011CYPR011C 981 nt13.59□□□□□ -0.23
NCR1Q12200 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt13.54□□□□□ -0.24
NCR1Q12200 ALF1YNL148C 765 nt13.52□□□□□ -0.25
NCR1Q12200 YLR236CYLR236C 324 nt13.49□□□□□ -0.25
NCR1Q12200 SUF2tP(AGG)C 72 nt13.47□□□□□ -0.25
NCR1Q12200 SUF10tP(AGG)N 72 nt13.47□□□□□ -0.25
NCR1Q12200 SIS1YNL007C 1059 nt13.46□□□□□ -0.25
NCR1Q12200 DSK2YMR276W 1122 nt13.42□□□□□ -0.26
NCR1Q12200 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt13.41□□□□□ -0.26
NCR1Q12200 Q0255Q0255 1419 nt13.4□□□□□ -0.26
NCR1Q12200 YCH1YGR203W 447 nt13.39□□□□□ -0.27
NCR1Q12200 PTP1YDL230W 1008 nt13.38□□□□□ -0.27
NCR1Q12200 AI5_BETAQ0075 1065 nt13.38□□□□□ -0.27
NCR1Q12200 MEP2YNL142W 1500 nt13.37□□□□□ -0.27
NCR1Q12200 FMP45YDL222C 930 nt13.35□□□□□ -0.27
NCR1Q12200 TIR4YOR009W 1464 nt13.35□□□□□ -0.27
NCR1Q12200 Q0010Q0010 387 nt13.34□□□□□ -0.27
NCR1Q12200 YOR169CYOR169C 465 nt13.32□□□□□ -0.28
NCR1Q12200 RPP2AYOL039W 321 nt13.31□□□□□ -0.28
NCR1Q12200 IMP2'YIL154C 1041 nt13.3□□□□□ -0.28
NCR1Q12200 YJL152WYJL152W 360 nt13.3□□□□□ -0.28
NCR1Q12200 YGL188CYGL188C 174 nt13.28□□□□□ -0.28
NCR1Q12200 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt13.26□□□□□ -0.29
NCR1Q12200 ART5YGR068C 1761 nt13.25□□□□□ -0.29
NCR1Q12200 DCW1YKL046C 1350 nt13.23□□□□□ -0.29
NCR1Q12200 LPX1YOR084W 1164 nt13.22□□□□□ -0.29
NCR1Q12200 CAC2YML102W 1407 nt13.22□□□□□ -0.29
NCR1Q12200 AI3Q0060 1248 nt13.2□□□□□ -0.3
NCR1Q12200 GFD2YCL036W 1701 nt13.19□□□□□ -0.3
NCR1Q12200 ERV46YAL042W 1248 nt13.17□□□□□ -0.3
NCR1Q12200 SRN2YLR119W 642 nt13.17□□□□□ -0.3
NCR1Q12200 PET9YBL030C 957 nt13.14□□□□□ -0.31
NCR1Q12200 YMR057CYMR057C 372 nt13.14□□□□□ -0.31
NCR1Q12200 IDH1YNL037C 1083 nt13.13□□□□□ -0.31
NCR1Q12200 SPP1YPL138C 1062 nt13.11□□□□□ -0.31
NCR1Q12200 YCR099CYCR099C 468 nt13.08□□□□□ -0.32
NCR1Q12200 YDR433WYDR433W 441 nt13.05□□□□□ -0.32
NCR1Q12200 GBP2YCL011C 1284 nt13.05□□□□□ -0.32
NCR1Q12200 MXR2YCL033C 507 nt13.05□□□□□ -0.32
NCR1Q12200 YKR040CYKR040C 504 nt13.01□□□□□ -0.33
NCR1Q12200 EMI2YDR516C 1503 nt13.01□□□□□ -0.33
NCR1Q12200 IRC15YPL017C 1500 nt13.01□□□□□ -0.33
NCR1Q12200 FPS1YLL043W 2010 nt13□□□□□ -0.33
NCR1Q12200 ATP6Q0085 780 nt13□□□□□ -0.33
NCR1Q12200 RTS2YOR077W 699 nt12.97□□□□□ -0.33
NCR1Q12200 ARP10YDR106W 855 nt12.96□□□□□ -0.33
NCR1Q12200 DED1YOR204W 1815 nt12.95□□□□□ -0.34
NCR1Q12200 YDL221WYDL221W 552 nt12.94□□□□□ -0.34
NCR1Q12200 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.94□□□□□ -0.34
NCR1Q12200 RRD1YIL153W 1182 nt12.91□□□□□ -0.34
NCR1Q12200 RTG1YOL067C 534 nt12.91□□□□□ -0.34
NCR1Q12200 MRPL8YJL063C 717 nt12.9□□□□□ -0.34
NCR1Q12200 SSA4YER103W 1929 nt12.88□□□□□ -0.35
NCR1Q12200 GIS3YLR094C 1509 nt12.88□□□□□ -0.35
NCR1Q12200 PET20YPL159C 762 nt12.86□□□□□ -0.35
NCR1Q12200 TCD2YKL027W 1344 nt12.84□□□□□ -0.35
NCR1Q12200 AIR1YIL079C 1083 nt12.83□□□□□ -0.36
NCR1Q12200 CUE1YMR264W 612 nt12.83□□□□□ -0.36
NCR1Q12200 FMT1YBL013W 1206 nt12.82□□□□□ -0.36
NCR1Q12200 FRD1YEL047C 1413 nt12.81□□□□□ -0.36
NCR1Q12200 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt12.81□□□□□ -0.36
NCR1Q12200 YEL076CYEL076C 651 nt12.81□□□□□ -0.36
NCR1Q12200 YLR464WYLR464W 651 nt12.81□□□□□ -0.36
NCR1Q12200 ARA2YMR041C 1008 nt12.78□□□□□ -0.36
NCR1Q12200 SDH1YKL148C 1923 nt12.74□□□□□ -0.37
NCR1Q12200 YBR220CYBR220C 1683 nt12.74□□□□□ -0.37
NCR1Q12200 YMR090WYMR090W 684 nt12.74□□□□□ -0.37
NCR1Q12200 SCC4YER147C 1875 nt12.7□□□□□ -0.38
NCR1Q12200 ADO1YJR105W 1023 nt12.69□□□□□ -0.38
NCR1Q12200 SOR2YDL246C 1074 nt12.67□□□□□ -0.38
NCR1Q12200 SOR1YJR159W 1074 nt12.67□□□□□ -0.38
NCR1Q12200 YNR068CYNR068C 819 nt12.66□□□□□ -0.38
NCR1Q12200 snR78snR78 87 nt12.63□□□□□ -0.39
NCR1Q12200 KTR3YBR205W 1215 nt12.62□□□□□ -0.39
NCR1Q12200 PTH1YHR189W 573 nt12.6□□□□□ -0.39
NCR1Q12200 UBX6YJL048C 1191 nt12.6□□□□□ -0.39
NCR1Q12200 YCL042WYCL042W 360 nt12.57□□□□□ -0.4
NCR1Q12200 FMP52YER004W 696 nt12.56□□□□□ -0.4
NCR1Q12200 YIL100WYIL100W 354 nt12.56□□□□□ -0.4
NCR1Q12200 ABZ2YMR289W 1125 nt12.56□□□□□ -0.4
NCR1Q12200 ADH2YMR303C 1047 nt12.56□□□□□ -0.4
NCR1Q12200 CWP1YKL096W 720 nt12.54□□□□□ -0.4
NCR1Q12200 YLR122CYLR122C 378 nt12.54□□□□□ -0.4
NCR1Q12200 NEM1YHR004C 1341 nt12.52□□□□□ -0.41
NCR1Q12200 YPL168WYPL168W 1293 nt12.51□□□□□ -0.41
NCR1Q12200 UTP6YDR449C 1323 nt12.51□□□□□ -0.41
NCR1Q12200 HUA1YGR268C 597 nt12.5□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 42.8 ms