Protein–RNA interactions for Protein: Q07478

SUB2, ATP-dependent RNA helicase SUB2, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SUB2Q07478 SUF10tP(AGG)N 72 nt14.09□□□□□ -0.15
SUB2Q07478 YCH1YGR203W 447 nt14.08□□□□□ -0.16
SUB2Q07478 YLR236CYLR236C 324 nt14.07□□□□□ -0.16
SUB2Q07478 ALF1YNL148C 765 nt14.07□□□□□ -0.16
SUB2Q07478 YJL152WYJL152W 360 nt14□□□□□ -0.17
SUB2Q07478 MRPL8YJL063C 717 nt13.97□□□□□ -0.17
SUB2Q07478 NME1NME1 340 nt13.94□□□□□ -0.18
SUB2Q07478 IDH1YNL037C 1083 nt13.87□□□□□ -0.19
SUB2Q07478 YPS1YLR120C 1710 nt13.84□□□□□ -0.19
SUB2Q07478 LPX1YOR084W 1164 nt13.83□□□□□ -0.2
SUB2Q07478 ADO1YJR105W 1023 nt13.82□□□□□ -0.2
SUB2Q07478 YDR095CYDR095C 411 nt13.8□□□□□ -0.2
SUB2Q07478 ERV46YAL042W 1248 nt13.8□□□□□ -0.2
SUB2Q07478 YDR433WYDR433W 441 nt13.78□□□□□ -0.2
SUB2Q07478 SIS1YNL007C 1059 nt13.76□□□□□ -0.21
SUB2Q07478 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt13.72□□□□□ -0.21
SUB2Q07478 YEL076CYEL076C 651 nt13.72□□□□□ -0.21
SUB2Q07478 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt13.72□□□□□ -0.21
SUB2Q07478 YLR464WYLR464W 651 nt13.72□□□□□ -0.21
SUB2Q07478 SPP1YPL138C 1062 nt13.72□□□□□ -0.21
SUB2Q07478 YKR040CYKR040C 504 nt13.69□□□□□ -0.22
SUB2Q07478 GBP2YCL011C 1284 nt13.68□□□□□ -0.22
SUB2Q07478 TIR4YOR009W 1464 nt13.65□□□□□ -0.22
SUB2Q07478 RPP2AYOL039W 321 nt13.6□□□□□ -0.23
SUB2Q07478 RTG1YOL067C 534 nt13.59□□□□□ -0.23
SUB2Q07478 UBX6YJL048C 1191 nt13.56□□□□□ -0.24
SUB2Q07478 MXR2YCL033C 507 nt13.56□□□□□ -0.24
SUB2Q07478 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt13.55□□□□□ -0.24
SUB2Q07478 CAC2YML102W 1407 nt13.55□□□□□ -0.24
SUB2Q07478 ART5YGR068C 1761 nt13.52□□□□□ -0.25
SUB2Q07478 YMR057CYMR057C 372 nt13.5□□□□□ -0.25
SUB2Q07478 PET9YBL030C 957 nt13.49□□□□□ -0.25
SUB2Q07478 TCD2YKL027W 1344 nt13.47□□□□□ -0.25
SUB2Q07478 HUA1YGR268C 597 nt13.47□□□□□ -0.25
SUB2Q07478 PTP1YDL230W 1008 nt13.4□□□□□ -0.26
SUB2Q07478 MEP2YNL142W 1500 nt13.38□□□□□ -0.27
SUB2Q07478 GFD2YCL036W 1701 nt13.37□□□□□ -0.27
SUB2Q07478 YDR094WYDR094W 336 nt13.3□□□□□ -0.28
SUB2Q07478 FRD1YEL047C 1413 nt13.26□□□□□ -0.29
SUB2Q07478 DED1YOR204W 1815 nt13.25□□□□□ -0.29
SUB2Q07478 YCL042WYCL042W 360 nt13.24□□□□□ -0.29
SUB2Q07478 PTH1YHR189W 573 nt13.2□□□□□ -0.3
SUB2Q07478 RRD1YIL153W 1182 nt13.2□□□□□ -0.3
SUB2Q07478 FPS1YLL043W 2010 nt13.19□□□□□ -0.3
SUB2Q07478 SPT5YML010W 3192 nt13.19□□□□□ -0.3
SUB2Q07478 YKL030WYKL030W 606 nt13.18□□□□□ -0.3
SUB2Q07478 YLR235CYLR235C 399 nt13.18□□□□□ -0.3
SUB2Q07478 RTS2YOR077W 699 nt13.18□□□□□ -0.3
SUB2Q07478 DCW1YKL046C 1350 nt13.17□□□□□ -0.3
SUB2Q07478 SOR2YDL246C 1074 nt13.08□□□□□ -0.32
SUB2Q07478 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt13.08□□□□□ -0.32
SUB2Q07478 SOR1YJR159W 1074 nt13.08□□□□□ -0.32
SUB2Q07478 FMT1YBL013W 1206 nt13.07□□□□□ -0.32
SUB2Q07478 EMI2YDR516C 1503 nt13.06□□□□□ -0.32
SUB2Q07478 CUE1YMR264W 612 nt13.05□□□□□ -0.32
SUB2Q07478 LCB1YMR296C 1677 nt13.05□□□□□ -0.32
SUB2Q07478 YMR090WYMR090W 684 nt13.02□□□□□ -0.33
SUB2Q07478 IRC15YPL017C 1500 nt13.01□□□□□ -0.33
SUB2Q07478 FMP52YER004W 696 nt13□□□□□ -0.33
SUB2Q07478 YDL221WYDL221W 552 nt12.99□□□□□ -0.33
SUB2Q07478 CWP1YKL096W 720 nt12.98□□□□□ -0.33
SUB2Q07478 YGR139WYGR139W 339 nt12.97□□□□□ -0.33
SUB2Q07478 YIL100WYIL100W 354 nt12.97□□□□□ -0.33
SUB2Q07478 GIS3YLR094C 1509 nt12.93□□□□□ -0.34
SUB2Q07478 ADH2YMR303C 1047 nt12.9□□□□□ -0.34
SUB2Q07478 TIM23YNR017W 669 nt12.89□□□□□ -0.35
SUB2Q07478 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt12.88□□□□□ -0.35
SUB2Q07478 RRT5YFR032C 870 nt12.85□□□□□ -0.35
SUB2Q07478 PAU16YKL224C 372 nt12.83□□□□□ -0.36
SUB2Q07478 DIC1YLR348C 897 nt12.83□□□□□ -0.36
SUB2Q07478 YFR018CYFR018C 1092 nt12.82□□□□□ -0.36
SUB2Q07478 SNF6YHL025W 999 nt12.81□□□□□ -0.36
SUB2Q07478 YLR179CYLR179C 606 nt12.81□□□□□ -0.36
SUB2Q07478 YPR064WYPR064W 420 nt12.8□□□□□ -0.36
SUB2Q07478 PCM1YEL058W 1674 nt12.78□□□□□ -0.36
SUB2Q07478 SCC4YER147C 1875 nt12.77□□□□□ -0.37
SUB2Q07478 SDH1YKL148C 1923 nt12.74□□□□□ -0.37
SUB2Q07478 SBA1YKL117W 651 nt12.72□□□□□ -0.37
SUB2Q07478 RNQ1YCL028W 1218 nt12.7□□□□□ -0.38
SUB2Q07478 TAD3YLR316C 969 nt12.69□□□□□ -0.38
SUB2Q07478 PRE6YOL038W 765 nt12.69□□□□□ -0.38
SUB2Q07478 YNL195CYNL195C 786 nt12.66□□□□□ -0.38
SUB2Q07478 YIH1YCR059C 777 nt12.64□□□□□ -0.39
SUB2Q07478 SSA4YER103W 1929 nt12.62□□□□□ -0.39
SUB2Q07478 AHT1YHR093W 549 nt12.61□□□□□ -0.39
SUB2Q07478 WSC2YNL283C 1512 nt12.6□□□□□ -0.39
SUB2Q07478 YBR220CYBR220C 1683 nt12.6□□□□□ -0.39
SUB2Q07478 YFL066CYFL066C 1179 nt12.54□□□□□ -0.4
SUB2Q07478 NAT4YMR069W 858 nt12.52□□□□□ -0.41
SUB2Q07478 AQY1YPR192W 918 nt12.52□□□□□ -0.41
SUB2Q07478 YLL053CYLL053C 459 nt12.51□□□□□ -0.41
SUB2Q07478 PEX25YPL112C 1185 nt12.51□□□□□ -0.41
SUB2Q07478 YSC84YHR016C 1407 nt12.49□□□□□ -0.41
SUB2Q07478 MET8YBR213W 825 nt12.49□□□□□ -0.41
SUB2Q07478 FRE6YLL051C 2139 nt12.48□□□□□ -0.41
SUB2Q07478 FTR1YER145C 1215 nt12.46□□□□□ -0.41
SUB2Q07478 GLK1YCL040W 1503 nt12.46□□□□□ -0.42
SUB2Q07478 SIM1YIL123W 1431 nt12.45□□□□□ -0.42
SUB2Q07478 BIO4YNR057C 714 nt12.45□□□□□ -0.42
SUB2Q07478 CLB6YGR109C 1143 nt12.44□□□□□ -0.42
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