Protein–RNA interactions for Protein: Q04048

SYF1, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SYF1Q04048 SUF2tP(AGG)C 72 nt14.87□□□□□ -0.03
SYF1Q04048 SUF10tP(AGG)N 72 nt14.87□□□□□ -0.03
SYF1Q04048 ALF1YNL148C 765 nt14.87□□□□□ -0.03
SYF1Q04048 MRPL8YJL063C 717 nt14.86□□□□□ -0.03
SYF1Q04048 YJL152WYJL152W 360 nt14.85□□□□□ -0.03
SYF1Q04048 LPX1YOR084W 1164 nt14.77□□□□□ -0.05
SYF1Q04048 SPP1YPL138C 1062 nt14.71□□□□□ -0.05
SYF1Q04048 ERV46YAL042W 1248 nt14.69□□□□□ -0.06
SYF1Q04048 IDH1YNL037C 1083 nt14.69□□□□□ -0.06
SYF1Q04048 ADO1YJR105W 1023 nt14.67□□□□□ -0.06
SYF1Q04048 YPS1YLR120C 1710 nt14.66□□□□□ -0.06
SYF1Q04048 YDR095CYDR095C 411 nt14.64□□□□□ -0.07
SYF1Q04048 YDR433WYDR433W 441 nt14.64□□□□□ -0.07
SYF1Q04048 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt14.61□□□□□ -0.07
SYF1Q04048 YEL076CYEL076C 651 nt14.61□□□□□ -0.07
SYF1Q04048 YLR464WYLR464W 651 nt14.61□□□□□ -0.07
SYF1Q04048 SIS1YNL007C 1059 nt14.59□□□□□ -0.07
SYF1Q04048 YKR040CYKR040C 504 nt14.56□□□□□ -0.08
SYF1Q04048 UBX6YJL048C 1191 nt14.55□□□□□ -0.08
SYF1Q04048 RTG1YOL067C 534 nt14.54□□□□□ -0.08
SYF1Q04048 TIR4YOR009W 1464 nt14.53□□□□□ -0.08
SYF1Q04048 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt14.52□□□□□ -0.09
SYF1Q04048 GBP2YCL011C 1284 nt14.52□□□□□ -0.09
SYF1Q04048 MXR2YCL033C 507 nt14.47□□□□□ -0.09
SYF1Q04048 RPP2AYOL039W 321 nt14.4□□□□□ -0.1
SYF1Q04048 CAC2YML102W 1407 nt14.37□□□□□ -0.11
SYF1Q04048 YMR057CYMR057C 372 nt14.36□□□□□ -0.11
SYF1Q04048 ART5YGR068C 1761 nt14.35□□□□□ -0.11
SYF1Q04048 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt14.33□□□□□ -0.12
SYF1Q04048 HUA1YGR268C 597 nt14.31□□□□□ -0.12
SYF1Q04048 PET9YBL030C 957 nt14.29□□□□□ -0.12
SYF1Q04048 TCD2YKL027W 1344 nt14.28□□□□□ -0.12
SYF1Q04048 PTP1YDL230W 1008 nt14.26□□□□□ -0.13
SYF1Q04048 GFD2YCL036W 1701 nt14.21□□□□□ -0.13
SYF1Q04048 YDR094WYDR094W 336 nt14.18□□□□□ -0.14
SYF1Q04048 MEP2YNL142W 1500 nt14.18□□□□□ -0.14
SYF1Q04048 FRD1YEL047C 1413 nt14.13□□□□□ -0.15
SYF1Q04048 DED1YOR204W 1815 nt14.12□□□□□ -0.15
SYF1Q04048 PTH1YHR189W 573 nt14.09□□□□□ -0.15
SYF1Q04048 RRD1YIL153W 1182 nt14.07□□□□□ -0.16
SYF1Q04048 YCL042WYCL042W 360 nt14.03□□□□□ -0.16
SYF1Q04048 FPS1YLL043W 2010 nt14.03□□□□□ -0.16
SYF1Q04048 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt14.02□□□□□ -0.17
SYF1Q04048 RTS2YOR077W 699 nt14.02□□□□□ -0.17
SYF1Q04048 YKL030WYKL030W 606 nt14.01□□□□□ -0.17
SYF1Q04048 DCW1YKL046C 1350 nt14□□□□□ -0.17
SYF1Q04048 SPT5YML010W 3192 nt13.98□□□□□ -0.17
SYF1Q04048 YLR235CYLR235C 399 nt13.98□□□□□ -0.17
SYF1Q04048 FMT1YBL013W 1206 nt13.96□□□□□ -0.17
SYF1Q04048 LCB1YMR296C 1677 nt13.91□□□□□ -0.18
SYF1Q04048 SOR2YDL246C 1074 nt13.9□□□□□ -0.18
SYF1Q04048 SOR1YJR159W 1074 nt13.9□□□□□ -0.18
SYF1Q04048 EMI2YDR516C 1503 nt13.85□□□□□ -0.19
SYF1Q04048 CUE1YMR264W 612 nt13.84□□□□□ -0.19
SYF1Q04048 IRC15YPL017C 1500 nt13.84□□□□□ -0.19
SYF1Q04048 CWP1YKL096W 720 nt13.8□□□□□ -0.2
SYF1Q04048 YDL221WYDL221W 552 nt13.77□□□□□ -0.21
SYF1Q04048 FMP52YER004W 696 nt13.75□□□□□ -0.21
SYF1Q04048 GIS3YLR094C 1509 nt13.74□□□□□ -0.21
SYF1Q04048 ADH2YMR303C 1047 nt13.73□□□□□ -0.21
SYF1Q04048 YIL100WYIL100W 354 nt13.71□□□□□ -0.21
SYF1Q04048 PAU16YKL224C 372 nt13.71□□□□□ -0.21
SYF1Q04048 YMR090WYMR090W 684 nt13.71□□□□□ -0.21
SYF1Q04048 TIM23YNR017W 669 nt13.69□□□□□ -0.22
SYF1Q04048 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt13.66□□□□□ -0.22
SYF1Q04048 SBA1YKL117W 651 nt13.66□□□□□ -0.22
SYF1Q04048 YFR018CYFR018C 1092 nt13.65□□□□□ -0.22
SYF1Q04048 RRT5YFR032C 870 nt13.64□□□□□ -0.23
SYF1Q04048 DIC1YLR348C 897 nt13.63□□□□□ -0.23
SYF1Q04048 YLR179CYLR179C 606 nt13.61□□□□□ -0.23
SYF1Q04048 PRE6YOL038W 765 nt13.6□□□□□ -0.23
SYF1Q04048 SNF6YHL025W 999 nt13.57□□□□□ -0.24
SYF1Q04048 PCM1YEL058W 1674 nt13.56□□□□□ -0.24
SYF1Q04048 YPR064WYPR064W 420 nt13.56□□□□□ -0.24
SYF1Q04048 SCC4YER147C 1875 nt13.53□□□□□ -0.24
SYF1Q04048 SDH1YKL148C 1923 nt13.49□□□□□ -0.25
SYF1Q04048 TAD3YLR316C 969 nt13.49□□□□□ -0.25
SYF1Q04048 RNQ1YCL028W 1218 nt13.48□□□□□ -0.25
SYF1Q04048 WSC2YNL283C 1512 nt13.44□□□□□ -0.26
SYF1Q04048 YIH1YCR059C 777 nt13.43□□□□□ -0.26
SYF1Q04048 YFL066CYFL066C 1179 nt13.41□□□□□ -0.26
SYF1Q04048 AHT1YHR093W 549 nt13.41□□□□□ -0.26
SYF1Q04048 YBR220CYBR220C 1683 nt13.36□□□□□ -0.27
SYF1Q04048 YNL195CYNL195C 786 nt13.35□□□□□ -0.27
SYF1Q04048 YLL053CYLL053C 459 nt13.31□□□□□ -0.28
SYF1Q04048 NAT4YMR069W 858 nt13.3□□□□□ -0.28
SYF1Q04048 PEX25YPL112C 1185 nt13.3□□□□□ -0.28
SYF1Q04048 YSC84YHR016C 1407 nt13.27□□□□□ -0.29
SYF1Q04048 SSA4YER103W 1929 nt13.26□□□□□ -0.29
SYF1Q04048 RRT12YCR045C 1476 nt13.24□□□□□ -0.29
SYF1Q04048 FTR1YER145C 1215 nt13.24□□□□□ -0.29
SYF1Q04048 Q0182Q0182 405 nt13.24□□□□□ -0.29
SYF1Q04048 AQY1YPR192W 918 nt13.24□□□□□ -0.29
SYF1Q04048 YNL115CYNL115C 1935 nt13.23□□□□□ -0.29
SYF1Q04048 BDH1YAL060W 1149 nt13.23□□□□□ -0.29
SYF1Q04048 YSP3YOR003W 1437 nt13.22□□□□□ -0.29
SYF1Q04048 BIO4YNR057C 714 nt13.22□□□□□ -0.29
SYF1Q04048 GLK1YCL040W 1503 nt13.22□□□□□ -0.29
SYF1Q04048 GAL1YBR020W 1587 nt13.21□□□□□ -0.29
SYF1Q04048 SIM1YIL123W 1431 nt13.2□□□□□ -0.3
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