Protein–RNA interactions for Protein: P52918

MSN5, Protein MSN5, yeastyeast

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSN5P52918 SPP1YPL138C 1062 nt15.11■□□□□ 0.01
MSN5P52918 SIS1YNL007C 1059 nt15.1■□□□□ 0.01
MSN5P52918 LPX1YOR084W 1164 nt15.09■□□□□ 0.01
MSN5P52918 DAL1YIR027C 1383 nt15.07■□□□□ 0
MSN5P52918 ERV46YAL042W 1248 nt15.05■□□□□ -0
MSN5P52918 FUN26YAL022C 1554 nt15.05■□□□□ -0
MSN5P52918 FPR4YLR449W 1179 nt15.04■□□□□ -0
MSN5P52918 BUD23YCR047C 828 nt15.03■□□□□ -0
MSN5P52918 FIS1YIL065C 468 nt14.98□□□□□ -0.01
MSN5P52918 CCT6YDR188W 1641 nt14.98□□□□□ -0.01
MSN5P52918 YDR094WYDR094W 336 nt14.93□□□□□ -0.02
MSN5P52918 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt14.93□□□□□ -0.02
MSN5P52918 PHO4YFR034C 939 nt14.92□□□□□ -0.02
MSN5P52918 IDH1YNL037C 1083 nt14.86□□□□□ -0.03
MSN5P52918 YJL152WYJL152W 360 nt14.85□□□□□ -0.03
MSN5P52918 HUA1YGR268C 597 nt14.84□□□□□ -0.03
MSN5P52918 YKR040CYKR040C 504 nt14.84□□□□□ -0.03
MSN5P52918 YDR433WYDR433W 441 nt14.83□□□□□ -0.04
MSN5P52918 SUF2tP(AGG)C 72 nt14.79□□□□□ -0.04
MSN5P52918 SUF10tP(AGG)N 72 nt14.79□□□□□ -0.04
MSN5P52918 ALF1YNL148C 765 nt14.68□□□□□ -0.06
MSN5P52918 GBP2YCL011C 1284 nt14.63□□□□□ -0.07
MSN5P52918 MXR2YCL033C 507 nt14.63□□□□□ -0.07
MSN5P52918 SBA1YKL117W 651 nt14.55□□□□□ -0.08
MSN5P52918 YPS1YLR120C 1710 nt14.49□□□□□ -0.09
MSN5P52918 TIR4YOR009W 1464 nt14.46□□□□□ -0.09
MSN5P52918 YDR095CYDR095C 411 nt14.4□□□□□ -0.1
MSN5P52918 TCD2YKL027W 1344 nt14.35□□□□□ -0.11
MSN5P52918 CAC2YML102W 1407 nt14.33□□□□□ -0.11
MSN5P52918 FRD1YEL047C 1413 nt14.32□□□□□ -0.12
MSN5P52918 YKL030WYKL030W 606 nt14.31□□□□□ -0.12
MSN5P52918 PAU16YKL224C 372 nt14.3□□□□□ -0.12
MSN5P52918 PTH1YHR189W 573 nt14.27□□□□□ -0.13
MSN5P52918 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt14.27□□□□□ -0.13
MSN5P52918 YLR235CYLR235C 399 nt14.23□□□□□ -0.13
MSN5P52918 YMR057CYMR057C 372 nt14.2□□□□□ -0.14
MSN5P52918 DED1YOR204W 1815 nt14.18□□□□□ -0.14
MSN5P52918 YFR018CYFR018C 1092 nt14.17□□□□□ -0.14
MSN5P52918 LCB1YMR296C 1677 nt14.16□□□□□ -0.14
MSN5P52918 RRT5YFR032C 870 nt14.15□□□□□ -0.14
MSN5P52918 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt14.15□□□□□ -0.14
MSN5P52918 PET9YBL030C 957 nt14.14□□□□□ -0.15
MSN5P52918 ART5YGR068C 1761 nt14.14□□□□□ -0.15
MSN5P52918 RPP2AYOL039W 321 nt14.13□□□□□ -0.15
MSN5P52918 YCL042WYCL042W 360 nt14.1□□□□□ -0.15
MSN5P52918 RRD1YIL153W 1182 nt14.09□□□□□ -0.15
MSN5P52918 PRE6YOL038W 765 nt14.06□□□□□ -0.16
MSN5P52918 SOR2YDL246C 1074 nt14.05□□□□□ -0.16
MSN5P52918 SOR1YJR159W 1074 nt14.05□□□□□ -0.16
MSN5P52918 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt14.01□□□□□ -0.17
MSN5P52918 GFD2YCL036W 1701 nt14□□□□□ -0.17
MSN5P52918 PTP1YDL230W 1008 nt13.99□□□□□ -0.17
MSN5P52918 FMT1YBL013W 1206 nt13.98□□□□□ -0.17
MSN5P52918 SNF6YHL025W 999 nt13.96□□□□□ -0.17
MSN5P52918 FPS1YLL043W 2010 nt13.9□□□□□ -0.18
MSN5P52918 SPT5YML010W 3192 nt13.89□□□□□ -0.19
MSN5P52918 DIC1YLR348C 897 nt13.86□□□□□ -0.19
MSN5P52918 TIM23YNR017W 669 nt13.86□□□□□ -0.19
MSN5P52918 NAT4YMR069W 858 nt13.78□□□□□ -0.2
MSN5P52918 MEP2YNL142W 1500 nt13.77□□□□□ -0.21
MSN5P52918 FMP52YER004W 696 nt13.76□□□□□ -0.21
MSN5P52918 CWP1YKL096W 720 nt13.75□□□□□ -0.21
MSN5P52918 YPR064WYPR064W 420 nt13.74□□□□□ -0.21
MSN5P52918 YLR179CYLR179C 606 nt13.72□□□□□ -0.21
MSN5P52918 RTS2YOR077W 699 nt13.71□□□□□ -0.21
MSN5P52918 YFL066CYFL066C 1179 nt13.7□□□□□ -0.22
MSN5P52918 TAD3YLR316C 969 nt13.7□□□□□ -0.22
MSN5P52918 ADH2YMR303C 1047 nt13.68□□□□□ -0.22
MSN5P52918 Q0182Q0182 405 nt13.67□□□□□ -0.22
MSN5P52918 PEX25YPL112C 1185 nt13.65□□□□□ -0.22
MSN5P52918 YMR244WYMR244W 1068 nt13.64□□□□□ -0.23
MSN5P52918 GLK1YCL040W 1503 nt13.62□□□□□ -0.23
MSN5P52918 CUE1YMR264W 612 nt13.61□□□□□ -0.23
MSN5P52918 WSC2YNL283C 1512 nt13.6□□□□□ -0.23
MSN5P52918 AHT1YHR093W 549 nt13.59□□□□□ -0.23
MSN5P52918 MSF1YPR047W 1410 nt13.58□□□□□ -0.24
MSN5P52918 DCW1YKL046C 1350 nt13.56□□□□□ -0.24
MSN5P52918 IRC15YPL017C 1500 nt13.5□□□□□ -0.25
MSN5P52918 RNQ1YCL028W 1218 nt13.49□□□□□ -0.25
MSN5P52918 YSP3YOR003W 1437 nt13.48□□□□□ -0.25
MSN5P52918 YNL115CYNL115C 1935 nt13.47□□□□□ -0.25
MSN5P52918 THI74YDR438W 1113 nt13.47□□□□□ -0.25
MSN5P52918 PCM1YEL058W 1674 nt13.45□□□□□ -0.26
MSN5P52918 MIR1YJR077C 936 nt13.44□□□□□ -0.26
MSN5P52918 YIH1YCR059C 777 nt13.43□□□□□ -0.26
MSN5P52918 YIL100WYIL100W 354 nt13.43□□□□□ -0.26
MSN5P52918 BDH1YAL060W 1149 nt13.43□□□□□ -0.26
MSN5P52918 GLR1YPL091W 1452 nt13.42□□□□□ -0.26
MSN5P52918 SSA4YER103W 1929 nt13.41□□□□□ -0.26
MSN5P52918 EMI2YDR516C 1503 nt13.4□□□□□ -0.26
MSN5P52918 GIS3YLR094C 1509 nt13.38□□□□□ -0.27
MSN5P52918 RBG2YGR173W 1107 nt13.37□□□□□ -0.27
MSN5P52918 YDL221WYDL221W 552 nt13.36□□□□□ -0.27
MSN5P52918 YLR415CYLR415C 339 nt13.35□□□□□ -0.27
MSN5P52918 YMR090WYMR090W 684 nt13.33□□□□□ -0.28
MSN5P52918 AQY1YPR192W 918 nt13.31□□□□□ -0.28
MSN5P52918 YSC84YHR016C 1407 nt13.3□□□□□ -0.28
MSN5P52918 VPS75YNL246W 795 nt13.27□□□□□ -0.29
MSN5P52918 DAT1YML113W 747 nt13.26□□□□□ -0.29
MSN5P52918 YLL053CYLL053C 459 nt13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 19.7 ms